重新理解光绪帝在政变之后的病，我的看法是：既有生理上的，更有心理上的。光绪帝幼年时代就身体不好是事实，肾功能有问题也是显而易见，大婚十年依然没有儿子，可能就和其身体状况有关。至于心理上的，既然说不清楚与康、梁“保皇”运动的关系，那剩下的路只有一个，以离开换取太后的认同、信任。所以我们看1898年底几个月和1899年全年，光绪帝的病情时好时坏，法国公使馆医生公开给出的诊断也说明光绪帝有病，但不至于影响履行皇帝职务，没有换人的必要。（“中国近代史资料丛刊”《戊戌变法》卷三，549页）但是到了1899年底，清廷政治还是出了问题，“己亥建储”，为光绪帝过继了一个接班人大阿哥。戊戌政变后，愤怒的慈禧太后确曾想过废掉光绪，再立新君。事实上，政变之后差不多一年，慈禧太后就为光绪挑选了一个“大阿哥”，以为预备，但在中外、朝野压力下最终放弃。
大阿哥事件是晚清政治发展的一个转折，一方面引发了稍后的民族主义排外运动，让清帝国为此付出巨大代价；另一方面，两宫关系通过这一巨大的历史转折重建了互信，当然主要是慈禧太后对光绪帝的信任。这方面的效果是明显的，据与两宫关系密切的瞿鸿禨说：“丁酉戊戌间，传闻误会，似涉嫌疑，实已涣然冰释。圣慈圣孝，欢颜愉色，融洽太和。臣鸿禨初入枢廷，钦圣谕臣，曰：‘外间疑我母子不如初乎？试思皇帝入承大统，本我亲侄。以外家言，又我亲妹妹之子，我岂有不爱怜者？皇帝抱入宫时，才四岁，气体不充实，脐间常流湿不干，我每日亲以涤拭，昼间常卧我寝榻上，时其寒暖，加减衣矜，节其饮食。皇帝自在邸时，即胆怯畏闻声震，我皆亲护持之。我日书方纸课皇帝识字，口授读四书诗经，我爱怜唯恐不至，尚安有他？’”按照瞿鸿禨的记录，即便两宫在戊戌秋因“围园劫后”传闻一度失和、误会，但在稍后就获得了解决，两宫和睦是主基调。
慈禧太后治下的光绪王朝就是太后的时代，光绪帝独立主持政治的时间非常短暂，满打满算不过就是1888-1898间十年。这十年，太后也没有完全不管不问，事实真相或许就像她在政变后训斥大臣所说的那样：“皇帝无知，汝等何不力谏？以为我真不管，听他亡国败家乎？我早已知他不足以承大业，不过时事多艰，不易轻举妄动，只得留心稽查管束；我虽人在颐和园，而心时时在朝中也。我惟恐有奸人蛊惑，所以常嘱汝等不可因他不肖，便不肯尽心国事；现幸我还康健，必不负汝等也。今春奕劻再四说，皇上既肯励精图治，谓我亦可省心，我因想外臣不知其详，并有不学无术之人，反以为我把持，不许他放手办事，今日可知其不行矣。他是我拥立者，他若亡国，其罪在我，我能不问乎？汝等不力诤，是汝等罪也。”
