1511年2月，大征服者阿尔布克尔克决心挥师东方的马六甲城，从而必须暂时离开自己的果阿新基地。这不仅造成当地的葡萄牙驻军数量锐减，也给蓄势待发的贾布尔苏丹以利好机会。后者随即发动数万大军，开始对昔日掌上明珠之城的全面进攻。
面对再次以排山倒海之势袭来的穆斯林军队，果阿城内只拿得出400名葡萄牙士兵抵御。虽然老盟友提摩吉曾被附上王位，但因为其出生种姓较低，所以很难为本地的印度教社会所认可。于是，在奥斯曼大将普拉德汗率领的围攻大军抵达前，这位印度大海盗就被出生更加高贵的梅尔劳所取代。然而，这也意味着葡萄牙人将失去很多能协助自己打仗的海盗群体。因此，除了以坚固的城防死扛，他们也拿不出什么更好办法。
按欧洲标准重修的果阿城墙
不过，由前两次交手造成的严重损耗，也在实际上影响着苏丹伊斯迈尔的军队构成。数量最少的奥斯曼志愿兵，已经因伤亡惨重而不能独立成军。与之情况类似的还有波斯裔雇佣兵，同样是由于补充困难而无法继续独当一面。于是，进攻者的枪炮火力就大打折扣，必须更多依赖自己的传统兵种构成。既突厥裔骑兵+印度教征召步兵所拼凑的中世纪武装。但因为数量众多，还是在很多方面保有优势。也因为葡萄牙士兵很少遭遇突厥系骑兵，所以在几次野外交锋中都不得要领。加上大部分海军舰船被抽调去马六甲作战，更让防御方不再能获得任何非对称优势。
很快，普拉德汗指挥他的军队冲过渡口，在果阿岛的东部建立了登陆场。但在继续前进的过程中，遭到重新修缮的城墙体系阻挡。那是由建筑师托马斯-费尔南德设计的欧式棱堡结构，非常有利于少量守军填补大部分射击盲区，从而使进攻方很难寻找到合适的突破口。
果阿本地的印度贵族夫妇
但印度军队也并非没有成功机会。他们首先在岛屿的外圈构筑营地和封锁线，迫使守军将仅有的4艘战舰都做了分散部署。随后又在果阿主城以东的狂野中建造了大型堡垒，用6000多驻军给城内防御者以巨大威慑，并缓慢开建更多的围攻阵地。只是苦于炮兵技术滞后与葡萄牙守备队的晚期，才始终无法打开局面。唯有借助雨季的恶劣天气，才从棱堡内部招降了少许变节者。苏丹伊斯迈尔对此也是非常不满，用新任的拉苏勒汗取代普拉德，但并不能从实际层面改善状况。
直到1512年10月，已经征服马六甲的阿尔布克尔克才率舰队返回果阿。除了同行的20艘大小风帆战舰，还有上面搭载的2500名葡萄牙和印度士兵。围攻者因惊恐万分而离开城墙附近，退到了6英里以外的堡垒据守。那里不仅是他们的长期营地，更是输送人员或物资的重要浮桥所在地，所以就势必成为对方反攻的重点攻击对象。深知这点的拉苏勒汗，也努力将全军中最为善战的人员都调往那里，不愿轻易承认自己面临失败。甚至还在渡口的两翼构筑栅栏，防止任何船只从水面靠近。
阿尔布克尔克的返回 预示着果阿守军开启反攻
面对这种头重脚轻的部署，阿尔布克尔克依旧选择用自己的王牌舰队充当开路先锋。先后有8艘中型战船被调来轰击栅栏与沿岸工事，准备彻底将6000多前出的敌军困死在果阿岛上。同时，还有一支超过千人的陆战队从城中出发，配合夹击堡垒内的突厥与印度守兵。他们都按照总督的要求，训练为当时欧陆刚刚兴起的瑞士长枪方阵，并能获得少量穿戴全套板甲的贵族重骑兵支援。这也是数量较少的一方，集中火力扫荡多数顽敌的必然选择。
战斗开始后，葡萄牙战舰很快就摧毁了几个陆地目标。在奥斯曼技术人员日益匮乏的窘境下，贾布尔苏丹国方面的还手能力也是日益消退。反倒是原本不应居于不利位置的舰炮，依靠射程、精准度与更为可惜的火药配比，将看似牢固的目标全都炸的底朝天。已经被分为左-中-右三路的方阵步兵，也几乎在同一时间开始了稳步推进。尤其是阿尔布克尔克本人所在的中路部队，更是稍稍领先于左右两侧的分队位置，充当全军的开路先锋。
从水面进攻浮桥的葡萄牙战舰
眼看自己的退路将被彻底封堵，要塞内的6000名步兵和200骑兵纷纷冲出来寻求决战。起初是快速机动的突厥骑兵，尝试以打了就跑的方式阻碍葡萄牙人前进。但面对有两翼火枪手助攻的长枪方阵，根本起不到多少拖延用处。
接着，是更多遵循古老传统的步兵蜂拥而至。除了火绳枪与复合弓的散射，也会用盾牌手硬抗最危险的前沿部分。但大部分土兵依旧需要挥刀突击，进而形成对前锋方阵的半包围状态。不过，随着行动稍晚的其他2个方阵抵达，这些刚刚取得微弱优势的印度步兵就无法坚持下去。加上很少遇到队列如此缜密的敌人，许多下级武士军官也不知道如何随机应变。
阿尔布克尔克一贯要求部下以方阵模式作战
最后，35名葡萄牙重骑兵从阵列最后方杀出，直接摧垮了贾布尔人的战斗意志。除少数人被杀或跳河逃跑，大部分残兵还是只能回到堡垒内部。阿尔布克尔克也适时的调来重炮，开始轰击土木结构的敌军营垒。加之河道内的舰船步步紧逼，几乎形成了全方位的火力覆盖。
八天后，失去全部希望的拉苏勒汗开始寻求和解。考虑到自身兵力还不足对手的50%，阿尔布克尔克也只能默许对方自行立刻果阿。作为交换条件，这些人也必须将几次战争中的叛逃者都交到自己手上。穆斯林方面则继续加码，要求对方不能威胁对这些改宗背教者的个人安全。在总督同意这个附加条款后，才以战败者的姿态离开当地。
葡萄牙士兵的陆战优势也在印度非常明显
事实上，这次规模比较有限的冲突，就是近代早期欧陆战术的印度次大陆首秀。相互配合、保护的长枪方阵，替代了传统的下马骑士与重装军士，足以获得更好的战斗效果。只是由于阿尔布克尔克之后的历任总督，往往需要应付更加紧迫的人力资源不足，才没有将类似改革在东方驻军中保留下去。
但果阿的安全已经通过这次冲突获得了更高保障，足以在之后的300多年时间里，充当整个葡属印度与其他东方殖民地的绝对首府。
