当初把魏东亭放在两江总督这个位置上，康熙有两重目的。
第一个目的是要魏东亭替康熙看着江南，毕竟南方原来是三藩的地盘。明朝的遗老遗少较多，又是大清的财税重地，不容有半点闪失。但凡有点风吹草动，必然要引起重视。而魏东亭从小和康熙一起长大，不但有着深厚的主仆情谊，而且经过擒鳌拜、平三藩等事的考验，魏东亭成为康熙比较信任的人之一，把卫东停放在这个位置上是非常合适的。
第二个目的也是比较现实的目的，那就是需要魏东亭为康熙筹集大量的”收台”资金。由于迁界禁海，当时大清的财力物力实际上是受到了很大的影响，东南三省财税锐减，这需要靠魏东亭的闪展腾挪，拆东墙补西墙，才能保持财政的正常运转。这个差事放到别人身上，康熙同样不会放心。
康熙有着严密、强大的监视系统，对朝内各种势力的暗流涌动非常清楚。
当康熙到了南京之后，发现魏东亭将所有的明孝陵附近的百姓全部和百姓进行交换，让士兵扮作百姓进行全方位戒严。康熙就明白魏东亭实际上并没有完全控制得住南京，魏东亭对南京的角角落落实际上并没有那么周全把握。
但是康熙此行的目的，就是为了让所有明朝的遗老遗少们看清楚自己的功业，宣告自己是承祚于明朝的。做的本来就是给百姓看的，而现在你让百姓住到军营去，百姓的平静生活遭到了打扰，反生怨言，结果就是适得其反。
另外康熙实际上对索额图收养红玉和朱三太子勾结是了如指掌，心中有数的。但是这一点作为两江总督的魏东亭却毫不知情。不单让假朱三太子杨起隆以“印空”的名义潜伏在栖霞山这么多年；竟然连红衣大炮的走失都没有及时掌握情况。这是让康熙几乎不可以容忍的。
但是在魏东亭这方面而言，这两件事真的怪不得魏东亭。
首先假朱三太子在魏东亭到任之前就已经潜伏在那里；
其次红衣大炮的走失也是必然的，因为魏东亭当年为了筹集军饷，实际上是悄悄开了部分海禁的，康熙对此是睁一只眼闭一只眼。
但是，因为索额图和朱三太子的“合流”，情况变得更为复杂。魏东亭如果继续留在两江总督的任上，不但无法替康熙继续监视江南，反而有可能会陷入到明索党争无辜成为牺牲品。
现在的魏东亭在这个局里陷得有多深？康熙还不能确定。因为结果的表现是魏东亭绝对忠于自己的，但过程当中，他与索额图牵扯有多深？尚不得知。毕竟两江是财税重地，富得流油。朝内的各种势力都会在两江布局。而此刻的索额图，康熙还没有打算动他。他仍然是国丈，仍然是康熙的肱骨之臣。但是时机成熟了处理索额图，魏东亭就得跟着白白牺牲了。
