1936年2月26日上午8时，日本反叛军人对内阁大臣的刺杀活动全部结束，叛乱者以陆相官邸为据点，由步兵第3联队的野中大尉率领约400名士兵，以重机枪8挺、轻机枪10余挺、步枪360支，占领了警视厅并切断了与外界的一切联系。
2月26日上午，东京市区完全陷入瘫痪状态。
从当日下午起，全市所有剧场、电影院一律被勒令关闭，文娱广播节目全部停止，只能定时播放当局发表的新闻。各报社的晚报也被迫停刊，整个东京市民处于极端的惊恐之中。
军人的“以下克上”行为再次震动了日本，震动了全世界。叛军兵变得手后满东京地发布“宣言书”，称：导致政治腐败、军人堕落、国家破坏的元老、重臣军阀、官僚、政党等一帮元凶，皆应诛杀铲除，以资实行天皇亲政的“昭和维新”。
内阁幸存者看出了军人欲实行他们所谓的“清君侧”的荒唐行动，便做出了辞职的决议。傍晚，冈田内阁决定总辞职，指定后藤内相为代理首相，全体阁员的辞呈于是日深夜送皇宫。
第二天，2月27日，残雪覆盖的东京进入了戒严状态。然而，叛军“清君侧”的行动，却首先激怒了日本国君——天皇裕仁。
当日午后，天皇召来了侍从武官长本庄繁大将，详细询问了事件的始末。平日一向温和的天皇今日显然动怒了，他以未曾有过的怒色狠狠地咒骂道：“肤所最信赖的老臣，一个个惨遭杀害，这还能说是报效国君的精神？像这样一些残暴军官是绝对不能宽怨的。”
并当下指示本庄繁大将：“命令戒严司令官收缴他们的武器，不得已时也可以用武力镇压。”
皇上的敕命，在当时的日本是最高圣命，必须无条件地执行。但纷乱的东京，非常时刻却是什么事都可能发生。事实上，命令并没有立即执行。
戒严司令官、东京警备司令香椎浩平中将，原来也是皇道派的同情者，他不但同情叛军，而且还完全默认了叛乱军官的行动，因而未立即执行镇压命令。
非但如此，他甚至把川岛陆相和杉山元参谋次长请到司令部，恳求他们给予谅解。
他说：“值此之际，作为和平解决的手段，只有请求天皇做出圣断，表示坚决实行昭和维新。反之，如果出动军队镇压，我相信谁都不愿意看到皇军相互残杀的悲剧出现。我打算立即进宫参见天皇，请求赐予断然实行维新的敕语。”
“根本不能同意你这个想法。迄今，不要说主管长官，甚至军界的长老都对他们进行了一而再再而三的耐心说服，可是这些叛乱军官一点也听不进去。即使从维护起码的军纪而言，也是不能宽怨的，必须马上遵照诏敕命令调动部队进行讨伐。”
杉山元大声疾呼，表示坚决反对。但是川岛陆相却只是心情沉重地一言不发。
“我改变原来决心，坚决进行讨伐！”
善于见风使舵的香椎浩平听到杉山元的这一番话，抱着双肘低头沉思良久后改变了自己的观点。
陆相官邸，安藤辉三大尉等叛乱军人也在紧急商议下一步行动。这次事变，叛军指挥者实际上受了日本法西斯理论家北一辉《日本改造法案大纲》思想的影响，如今事变已起，叛军自然会想到这位狂人，当下与北一辉进行了电话联系。
之后，决定以皇道派成员、原教育总监真崎甚三郎大将作为实施昭和维新的“正义军”首领，由他制定全部活动方针。但是，真崎显然不是他们的理想中人。
见事情闹大了，真崎突然改变了态度，在陆相官邸作了20来分钟的说教后表示：“各位如果继续坚持下去，势必成为皇军的罪人，我劝你们还是归顺吧！”
说完这番出乎意料的话后，真崎甚三郎怕沾上腥似得急忙离去。接二连三遭抛弃，反叛的少壮军官们处于进退维谷的境地。
他们在占据的山王饭店和幸乐餐馆上高高悬起了盲目信赖天皇的所谓“尊皇讨奸”的旗帜，岂知就是天皇本人视他们为凶暴的叛徒并命令严加镇压，这真是莫大的讽刺！
后来，一个被处死的叛乱军官，曾在遗书中写下这样的话：“我无比仇恨天皇背弃我们的忠实的行为。”
就在叛军一筹莫展之际，奉天皇大命实施讨伐的队伍，陆续从佐仓、甲府、宇都宫和高崎等地开进东京。
28日夜间，集结在赤板的叛乱部队，已经处于坦克部队的全面包围之中。24000名步兵也做好了战斗准备，预定于29日上午9时发动攻击，赤板附近的居民已受命撤离。
内外交困，使叛军有些军官开始动摇了。但是，“神一般的中队长”安藤辉三大尉坚持进行抵抗，使产生归降念头的人又缩了回去。
三宅板、山王一带，叛军部署了第一道抵抗防线。
29日晨，航空大厦的屋顶升起了“不要顽抗到底”的标语，坦克部队也开始行动，逐渐缩小了包围圈，这时叛军已成瓮中之鳖。
当坦克的履带声鸣响在安藤辉三大尉等人据守的山王饭店附近时，安藤辉三命令30余名士兵冲向电车道，一齐伏卧在坦克群的前面。
“反击坦克是不会有什么作用的，我们干脆就让它们从身上轧过去，让我们以死来表示抗议。”安藤辉三望着俯卧着的士兵，坚定地说。
坦克在安藤辉三等人面前停下来了，只是撒了撒传单就撤走了。这时安藤的顶头上司、步兵第3联队所属大队长伊集院少佐跑过来，泣不成声地对安藤说：
“安藤君，我再说一遍，停止无谓的抵抗，用自尽表示效忠吧！士兵实在可怜，命令他们回去吧！”
“我决不接受这样的命令，没有理由因为怕包围和威吓而表示屈服。我们的方法错了，原以为打倒重臣、阁员就能实行昭和维新，事实上，应该在这之前先打倒内阁。让我自尽，见鬼去吧！”
安藤辉三面如土色，但态度坚决地吼道。安藤辉三的怒吼，清楚地表明这场震撼日本全国的大事变所必然发生的真相。
长期以来，陆军中的皇道派和统制派，互相对立，明争暗斗，终于表面化。军阀相互间的内讧，使皇道派终为统制派所降服。
皇道派是一种超现实的天皇亲政论者，他们热衷于形而上学的改革。与此相反，统制派则是合理主义者的集合体，反对发动政变，主张在维持军事统制的前提下，实行合法的国家改造，所以也被日本人称为“政策派”。
统制派敌视皇道派，皇道派又以实力回击统制派。1925年8月，皇道派的相泽中佐，光天化日之下在陆军省内暗杀永田铁山军务局长就充分说明了这一点。
永田铁山被称为日本陆军中有名的秀才，又是统制派的巨头，所以被皇道派视为眼中钉。但是皇道派杀害永田，并不能为政变打开通道，今日“二•二六”事件的挫折再一次证明了这个事实。
事变最终平息了，整个过程，没有动用一枪一弹。官兵们一个个开始归顺，除了最强硬的安藤辉三大尉在山王饭店自杀未遂外，其余全部投降。
下士官以下人员仍回原部队，军官们被收容到宪兵队，这时，他们还寄希望于军部，寄希望于日益强大的军人法西斯势力。他们默默地期待着以后在法庭上的斗争。
然而，他们的期望只是一场梦，特别设置的军法会议是按紧急敕命召开的。从4月末开始，只进行了一审，而且既没有辩护人，又不公开审判，他们没有被给予发言的机会。
这场匆忙的判决，于7月初就结束了。
7月12日，在代代木陆军卫戍监狱的刑场，被宣判死刑的13名军官全部被枪决。
