雍正五年，雍正皇帝刚刚解决了罗卜藏丹津在西藏的叛乱，清王朝的西北之地再一次掀起了战火。
在三年前，岳钟琪带领五千精锐孤军突入青海，重创罗卜藏丹津之后，罗卜藏丹津逃出青海，投靠了策妄阿拉布坦所统辖的准噶尔部。
时日不久，策妄阿拉布坦去世，噶尔丹策零接替策妄阿拉布坦汗位，成为了准噶尔部新的领袖。刚刚接替汗位的噶尔丹策零野心勃勃，在新疆处处引发战端，还开始进攻清王朝驻守在新疆的士兵。
雍正六年初，雍正皇帝下令两路大军出兵征讨在伊犁附近叛乱的噶尔丹策零。
北路大军：傅尔丹带兵驻守在科布多
南路大军：岳钟琪带兵驻守在巴里坤
可是此时恰巧碰到了逃亡到准噶尔部落的罗卜藏丹津想要谋杀噶尔丹策零，夺取准噶尔部落的实际领导权。
这件事情被噶尔丹策零知晓后，率先出击，顺利拿下了罗卜藏丹津。
在此之前，罗卜藏丹津一直藏匿在准噶尔部落，雍正皇帝几次向策妄阿拉布坦索要罗卜藏丹津都无疾而终。聪明的噶尔丹策零想要利用罗卜藏丹津作为缓兵之计，一方面以此作为借口让清王朝放缓行军速度，另一方面则准备带兵袭取雍正皇帝下令出征的这两路大军。
雍正皇帝听到噶尔丹策零将要把罗卜藏丹津进献给清王朝的时候，急令岳钟琪和傅尔丹停止进军，同时下令将岳钟琪和傅尔丹调回了京师，留下了纪成斌和巴塞两个人分别统帅南北两路大军驻守在原地，不能擅自进兵。
噶尔丹策零知道雍正皇帝中了他的缓兵之计，带领了两万的精锐骑兵突袭科舍图。
科舍图为南路大军放养马匹所在地，这里几乎是南路大军精锐骑兵的供养地，可是噶尔丹策零的这次意外突袭却让南路大军损失惨重。驻守在这里的清军何曾有能力抵挡噶尔丹策零的这两万精锐骑兵，被圈养在这里的战马死伤过半，清军损失惨重。
雍正皇帝得知自己上当，又急急忙忙令岳钟琪和傅尔丹奔袭新疆，在南北两路大军附近加固了科布多和巴里坤两座城池的防御，构成了新的防御体系。
城池的加固，让噶尔丹策零开始诱敌主动出击。
噶尔丹策零知道岳钟琪行军谨慎，不会轻而易举的出兵征讨自己，遂决定将主意放在了北路大军统帅傅尔丹的身上。为了能够顺利诱惑傅尔丹出兵，噶尔丹策零让哨探放出消息，扬言自己的前锋部队驻守在博克托山岭，准备对北路大军发动突袭。
同时，自己的主力大军需要一段时间才能够与之会合。
南路大军统帅傅尔丹听到这个消息之后，觉得这是挫其锋芒的最好机会。
为了能够保证突袭噶尔丹策零前锋军队计划的成功，傅尔丹亲自统帅一万大军奔袭博克托。傅尔丹带领的这一万大军一路高歌猛进，追敌二百余里，敌人一直是且战且退，从来没有正面和傅尔丹的大军死磕。
傅尔丹的大军追敌至和通泊的时候，噶尔丹策零突然带领大军冲了出来，将傅而丹的大军重重包围，傅而丹的一万大军最终仅仅剩余了二千的兵马回到了科布多营地。
此次事件之后，作为南路统帅的岳钟琪也因为这件事情受到了牵连，朝廷以固守不援的罪名，将岳钟琪贬职，但仍留其在原驻地带领军队驻守。
雍正十年，岳钟琪向清廷提议在巴里坤的附近再造城池，作为巴里坤的战略相援之城，可以和巴里坤形成相互防御之势。清廷在收到岳钟琪的提议之后，遂同意了岳钟琪在木垒筑造新城。
七月，岳钟琪因为久无战功，被调回朝廷，雍正以鄂尔泰代替岳钟琪，统帅南路大军的军政大权。噶尔丹策零在得知这个消息之后，准备再次引兵进犯。
只不过噶尔丹策零这一次将进犯的目标放在了清军的外围势力。
噶尔丹策零从额尔齐斯河上游行军，最终抵达杭爱山，探知三音诺颜部在塔米尔河驻守，噶尔丹策零带领了三万大军意外扑杀过去，掠夺了大量的牲畜，可以说是收获颇丰。
可是，这一次的噶尔丹策零还反了了一个严重的错误，他还俘虏了当时清朝和硕亲王策凌的两个儿子和一个小妾。
策凌听闻这个消息，火速派遣哨探前去探寻噶尔丹策零的驻地，同时征集了三万的蒙古兵整军备战。在探知噶尔丹策零统兵驻守在光显寺北部的一处地方的时候，策凌统帅三万大军急行军到了光显寺的高地之上，准备在第二天黎明的时候发动进攻。
第二天刚刚黎民，策凌就带领三万大军从高地之上冲了下来，还在呼呼大睡的噶尔丹策零战甲都来不及穿戴，就马不停蹄的朝着西面溃逃，策凌追敌两日，一直追到了杭爱山西部附近。
此时的噶尔丹策零已经逃进了杭爱山的山谷之中，策凌紧追不舍，噶尔丹策零无奈之下将之前所掠夺的牲畜、辎重尽数抛弃，留在了山谷之中，堵塞了策凌的追击道路，才算逃脱了策凌的追击。
噶尔丹策零此次可以说是一无所获，还狼狈逃回了新疆伊犁。
但是，噶尔丹策零主导这股流动势力却仍旧在新疆肆意叛乱，清廷一时间也无可奈何。
清朝在建立之初，在对待蒙古、新疆、西藏问题上，总是试图用扶持贵族统领维系三者之间的矛盾。可是这种处理方式却仅仅在清朝初期是一个行之有效的方法。但是这种方式长此以往，如果当地的首领一旦试图叛乱，就会形成极大的影响力，以至于清王朝无法彻底根除叛乱。
清朝初期，将维系民族关系的希望过多的寄托在了当地贵族首领的身上，当地的军事力量在很多程度上是归属于贵族首领的，这也是为什么这些地方的首领具有极强的煽动性。
到了雍正王朝，雍正皇帝很明显已经认识到了这种弊端，遂开始渐渐强化在这些地方的驻守兵力，同时弱化这些贵族领袖对于当地的影响力，从而达到控制这些地方的目的。
在清朝，少数民族的叛乱一度成为清王朝在边境之地上的最大毒瘤，幸运的是，清王朝的初期几乎无一例外的出现了极为能掌驭王朝，能挥刀上马的强悍帝王，这对于清王朝而言无疑是最大的幸运。
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