在中国的农民起义历史上，太平天国算是一个另类：因为在太平天国运动之前，历朝历代的农民起义也确实有不少以秘密宗教为结社工具，然后对抗朝廷，甚至也存在基于秘密宗教基础上，被历史承认的割据王朝。比如东晋十六国时期，割据四川的成汉王朝，就是基于五斗米教（天师道）基础上的割据王朝。但是，不论是太平道、五斗米教，还是白莲教、罗教，这些秘密宗教在传教乃至发动农民起义的过程中，往往选择最大化不得罪儒家，甚至随着事业做大，白莲教起义军出身的将领，还会选择放弃白莲教，转而和儒家精英阶层合流（比如白莲教基础上，韩宋王朝的大将朱元璋）。
所以，当拜上帝会提出仇视孔子、仇视儒家知识分子的主张时，炭工和广大穷苦农民都是表示支持的。
而这一切，也都意味着，从太平天国初期开始，太平天国所面对的对手，就不仅仅是腐朽不堪、日落西山的晚清帝国，而是士绅集团，乃至儒家知识分子集团。
对于儒家知识分子来说，清取代明是可以接受的。毕竟清还是接受儒家的，但如果太平天国干翻清朝，则意味着儒家也会被连根拔起。这可是儒家知识分子所万万不能接受的。
