蒋介石领导的国军集团，内部派系林立、争执不断，而在这些派系中，蒋介石最器重的当属黄埔系将领。
蒋介石本人为何如此器重黄埔系将领，这还得从他本人的发家史说起。蒋介石东渡日本求学期间，还是个不起眼的炮兵预科学生，因此在很长一段时间内，蒋介石都渴望获得绝对力量，即军事武装的支持。
回国后，蒋介石被孙中山委以重任，成为黄埔军校的校长，这实际上给了他培养私人势力的机会。从接任黄埔军校校长一职以来，蒋介石就暗中观察哪些人可以成为自己的军事班底，而观察培养的对象并不限于学生，甚至还有军事教官，就比如陈诚、何应钦等人。
1925年，国民大革命爆发，蒋介石率领的黄埔学生军一路东征北讨，在军界闯出了赫赫威名。正因为如此，蒋介石也吸纳了一大批军事人才，也就是后世所称的黄埔系。不管后来蒋介石的地位有多高，这些黄埔系将领面见蒋介石时都只称校长，这也从侧面反映出他们是蒋介石的嫡系将领，而不是其余的杂牌部队。
除黄埔系以外，蒋介石还有一个特殊的军事班底，即保定系。与黄埔系相比，保定系可以说是蒋介石的娘家。为什么这么说呢？据资料记载，蒋介石留学日本前的学校就是陆军部陆军速成学堂，也就是保定军校的前身。因此，蒋介石上位后，对这个名将频出的娘家也格外器重。
在北伐战争期间，国民党高级将领中保定军校毕业生占很大比重。例如，仅第七军团以上的军官就有十二人是保定军校生，比例高达70%。另外，由于保定系将领受过严格而正规的军事训练，因此受到了国民政府的各集团的重视，不少人都成了显赫一时的封疆大吏。如曾任国民党副总裁的陈诚、新疆省政府主席的张治中、陆军总司令顾祝同都是保定系将领中的佼佼者。
不过，派系林立有利也有弊。在使用各军事派系的同时，蒋介石也痛下杀手，通过对各派系内掺沙子的方式取得绝对领导权。红极一时的政学系和CC系就是这次军事调整的受益者。
1931年12月，蒋介石被迫下野后，反思自己失败的原因是“由于余不能自主”，也就是党内纪律涣散导致蒋介石的政令不能有效传达。
恰在此时，以拥护蒋介石为宗旨的力行社成立，无疑给了蒋介石“党内改组”的借口。在改组过程中，蒋介石发现自己对知识阶级不太靠近，以至于党部毫无作用。这实际上为以学者居多的政学系上台创造了条件。
1932年，蒋介石复出，三大拥护蒋介石的派系也迎来了春天。在党务情报方面，陈氏兄弟的CC系成员遍布国军各个重要部门，势力庞大无比。当时国民党内都流传着这样一句话：蒋介石的天下，陈家的党。而这个陈家就指的是陈立夫、陈果夫兄弟的CC系。
但凡事都有例外，势力庞大的CC系也逃不过兴亡更替的历史周期律。为实现党政一把抓，蒋介石对CC系的厌恶日益明显，开始寻求新的智囊团，于是，学者型的政学系登上了历史舞台。
政学系的作用类似于古代的门客、军师，即给首领出谋划策的智囊团。在某一特定时刻，这些人的作用有时甚至决定大局的走向。正因为如此，这些人也被委以重任。蒋介石麾下的政学系人才都基本上担任要职，如熊式辉、张群、杨永泰等人都是典型的党国柱石。
1933年到1936年是政学系活动的黄金时期。当时蒋介石为顺利达到围剿红军的目的，专门在南昌建立行营，而政学系的核心人物杨永泰则兼任行营的秘书长一职。在围剿红军过程中，杨永泰为蒋介石制定了“三分军事，七分政治”的战略，令红军主力损失惨重。
不过后来，由于政学系在民族大义问题上是非不分，一直鼓动亲日活动。随着抗日战争的爆发，主张抗日的黄埔系和保定系趁机发难，再加上杨永泰的突然遇刺，政学系也顺势退出了历史舞台。
正是因为派系太多，导致国民党在解放战争中节节败退。不过，虽然黄埔系虽然表现不佳，但作为蒋介石亲手培养的嫡系，还是在国民党内保持着绝对地位！
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