台湾自古以来就是中国的领土。早在三国时期，吴人编写的《临海水土志》，就已对台湾作过明确记述，三国时孙吴政权曾派人去台湾考察、居住。到明中期，大陆赴台开拓者已达十余万人。只是，在明朝中期后，日本、西班牙、葡萄牙、荷兰殖民者相继侵扰台湾，明末，荷兰人打败西班牙、葡萄牙和日本倭寇，占据了台湾全岛，台湾沦为荷兰的殖民地。
幸好，在明末清初，有闽商郑成功家族，靠海上贸易积累起来的经济力量，将台湾从荷兰人手里抢了回来。当时，郑芝龙、郑成功、郑经家族是明末清初兴起的著名海商家族集团，在台海一带具有强大的商业实力，郑氏集团拥有“海陆十大商”，由“仁、义、礼、智、信”的“海五商”和“金、木、水、火、土”的“陆五商”构成。其对外贸易遍布东南亚各地，并与日本、欧洲一些国家也有海上商业往来。大规模的商业交往和贸易活动，使得郑氏集团积累起雄厚经济基础，因而也有了组建家族军队的经济基础。
郑成功原名森，他曾被南明第二位皇帝朱聿键赐国姓“朱”，并赐名“成功”，称“国姓爷”，又被南明永历帝朱由榔封为“延平王”，称“郑延平”。郑成功于1661年（清顺治十八年，永历十五年）率军横渡台湾海峡，并于翌年击败荷兰东印度公司在台湾大员（今台湾台南市境内）的驻军，收复台湾，开启郑氏在台湾的统治。
南明朱聿键的隆武政权灭亡后，郑成功避走金门，招来沿海各地军马，于1647年（清顺治四年，永历元年）一月，以“忠孝伯招讨大将军罪臣国姓”之名誓师反清。此后，郑成功成了南明反清的一面旗帜。郑成功曾率兵与清军多次激战，特别是兵伐潮州、北伐南京，表现出反清的坚强斗志。清廷也多次想招抚郑成功，但皆被拒绝。
郑成功病逝后，其子郑经继位，清廷加紧了对郑经的招降步伐，但都没有成功。后来，郑经病死，郑经之子、年仅12岁的郑克塽嗣立，但大权实际上为冯锡范、刘国轩所掌握。此时，郑克塽年少，台湾政权不稳固，而且，清廷在平定“三藩”之后，也有了军事力量来对付台湾，因而，清廷对台湾的政策，由招抚转变为进剿。
收复台湾被提上了日程，施琅任水师提督
郑克塽继位为延平王之后，福建总督姚启圣认为台湾政权不稳，是清军进攻台湾的好时机，但是，福建水师提督万正色却提出了反对意见。随后，内阁学士李光地建言推举施琅担任平台将领，总督姚启圣也赞同，于是，皇帝采纳了他们的建议，将原水师提督万正色调任陆师提督，由施琅任水师提督。
李光地
李光地和姚启圣之所以推举施琅任平台将领，而康熙帝随即任命其为水师提督，这是有原因的。
施琅（1621年——1696年）是福建省泉州府晋江县（今晋江市龙湖镇衙口村）人，在海边长大，他原是郑成功的父亲郑芝龙的部将，顺治三年（1646年）他跟随郑芝龙降清。但因不满清军将领对他的轻视，不久，他又加入郑成功的抗清义旅，成为郑成功的得力助手。只是，施琅是有主见有傲气的将领，郑成功手下亲信曾德曾一度得罪了施琅，施琅不能忍受，借故杀了曾德，因此而与郑成功发生了矛盾，后来，矛盾激化，郑成功杀了施琅父亲和兄弟。施琅与郑成功结成家仇，无法继续在抗清队伍中待下去了，于是，施琅再次降清。
施琅投降清后，被任命为清军同安副将，不久，又被提升为同安总兵。李光地和姚启圣是比较了解施琅的，他是当时进攻台湾郑氏集团的最合适的统兵将领。
首先，施琅生长在海边，自幼随父从事海上贸易活动，精通航海，对海疆的气候、地理等方面的情况非常熟悉，而且，在从军之后，他多次转战东南沿海，有丰富的海上作战经验，是很出色的水师将领。
其次，施琅与一般的海商生意人不同，他通晓水师的战法、阵法，而且，他一贯主张以武力统一台湾，他不是鲁莽的将领，而是很有韬略的水师指挥官。他对台用兵的方略是经过再三深思而拟定的。他提出“因剿寓抚”的战略方针以及一整套实施方案，是切实可行的。还有，施琅对武力统一台湾很有信心。
施琅
再次，施琅降清前是郑氏集团的重要将领，对台湾郑氏集团内情非常了解，对郑氏集团的政治、军事状况了如指掌，他海战韬略令郑军官兵所畏惧。而且，他对郑氏有家仇，他希望能打败郑氏集团。而清廷不会担心他与郑氏集团有勾结。中的故旧很多，为他争取内应和行情报工作提供了便利条件。第四，施琅不但是武力统一的坚决拥护者，而且对统一充满信心。
所以，康熙帝对李光地和姚启圣推荐施琅任平台将领比较满意，康熙二十年（1681年），康熙帝任命施琅为福建水师提督，负责部署平台的军事事宜。
平台前军政官员出现矛盾，施琅执掌平台大权
平台前，依照康熙帝的计划，是想由福建总督姚启圣、巡抚吴兴祚、陆师提督万正色、水师提督施琅一起商讨平台的作战计划，联手打击郑氏集团。
可是，当时的平台前线福建的军政官员存在着不同的主张和一定的矛盾。姚启圣作为福建总督，又是在郑经死后最先提出平台的，他想掌控全局，指挥平台的主要事务；但是，施琅却感到他与姚启圣很难取得一致意见，因而，他想摆脱姚启圣等人的节制，全权指挥进攻台湾的军事事务，双方的意见难以统一。最后，经上奏上，康熙帝作出了决定。
康熙首先批准巡抚吴兴祚负责平台的后勤保障，接着，令姚启圣和施琅共同出兵征讨台湾。康熙此举，据学者分析，有他作为帝王的用意，他相信施琅指挥海战的出色才能，想让施琅指挥水师平台，但是，他又不能让长期在海上征战、熟知台湾军事力量的施琅独掌平台的权力，担心平台获胜之后，留下新的麻烦，所以，他让姚启圣一同出兵，以之来节制施琅。而姚启圣虽为福建总督，也熟悉军务，但在海战方面，他的指挥能力和对郑氏集团的了解，不如施琅，所以，又需要施琅来指挥水师。
姚启圣
康熙二十一年五月初五（1682年6月10日），清军水师的先头部队抵达铜山岛，但姚启圣和施琅却仍在争执出兵时机和指挥权问题，姚启圣主张利用冬天的北风，顺风顺势来攻击郑氏水师；而施琅却主张利用夏天的西南风，避免冒风险，稳妥攻台。
施琅“治军严整，通阵法，尤善水战，谙海中风候”，他在指挥海战方面，有其独到的才能。施琅之所以力主清军水师一反在东北风季节渡海作战的惯例，而选在西南风始发的六月中旬出兵，这是因为：“北风日夜猛，今攻澎湖，未能一战克，风起舟散，将何以战？夏至前后二十余日，风微，夜尤静，可聚泊大洋，观衅而功，不过七日，举之必矣。”施琅见解独到，他看到了利用西南风，才是渡海的优势。
可是，姚启圣等却强烈反对施琅的主张，他们认为，水师出海，必须顺风顺势，进击澎湖、台湾，只有充分利用西北风，才能占有优势，有效打击郑氏水师。
双方争执不停，最后，康熙帝于十月初六（11月15日）作出裁定，由施琅负责指挥前线作战，而姚启圣改任负责后勤作业，自此，施琅终于如愿地取得了平台的指挥大权，全权统帅清军水师。十一月初三（12月1日）施琅率领约21000人，军舰238艘前往兴化平海卫训练军队，以做好来年夏天征台的准备。
澎湖海战
施琅的平台计划，确实有他的独到之处，首先，若是在冬天西部风大时出海，有可能在海上遇到狂风，不得不在中途抛锚，如此一来，就危险了。其次，施琅在渡海的航路上，没有选择以往从金、厦出航而奔向台湾的途径，而是一反惯例，从靠南的铜山岛出发，利用西南风，直取澎湖以南郑军设防薄弱的各个岛屿，而占据这些岛屿，可以作为攻台的基地。有利于下一步向北转入澎湖海域，顺风顺流列阵对敌。再次，澎湖海域六月多风，而且多是温和的西南风，这有利于清军水师集中兵力攻击敌军水师。可见，相比较而言，施琅的平台策略，比姚启圣要更妥当更切实一些。
郑氏集团的军事动向和防卫措施
从康熙十八年（1679年）起，清朝实施迁界令，这严重打击了郑氏集团的海上贸易，以及其军队的粮食补给，致使郑氏集团的军队出现了给养上的困境。当时主政的郑经下令澎、台居民每户人家每个月必须多缴一斗米，而军队将领也必须用自己的俸禄来充军军饷。这种对民众横征暴敛的举动，以及损害军官利益的举措，使郑氏集团的军队战斗力逐渐减弱。
康熙十九年（1680年），郑经退守台湾，澎湖成了前线的军事要地，但由于远离台湾，防守相当脆弱。同年十月，施琅抵达厦门，郑军内部傅为霖拟作清军内应，但事情败露。此时让郑经感到澎湖防守有问题，于是，郑经才派郑军名将刘国轩前往澎湖，加强澎湖的防卫。刘国轩抵达澎湖后，在娘妈宫、风柜尾、四角屿、鸡笼屿等筑城设防；并在东莳、西莳、内堑、外堑、西屿头、牛心山等处设置了炮台，此外，还在海边建造矮墙并配置火铳，全面加强了澎湖的防备力量。
康熙二十二年（1683年），施琅准备进攻澎、台的消息传到了郑氏军中，为了进一步加强澎湖的防卫，刘国轩又从台湾本岛调度乡兵到澎湖，强化防守；并将商船以及私人用船都改为军舰，包括大小炮船、鸟船、赶缯船、洋船、双帆等，共有各类船只200多艘，做好了与），准备在澎湖与施琅决战。
刘国轩
刘国轩熟知海战，是水师名将，他在澎湖的布防可谓万无一失。只可惜，刘国轩遇到了更厉害的对手施琅。
施琅出其不意、攻其不备，击败郑氏水师，平定台湾
康熙二十二年六月十四日（1683年7月8日），施琅从铜山岛出发，姚启圣也派出3000人同施琅一起出征，当时，清军约24000人，大鸟船70艘、赶缯船103艘、双帆居船65艘。清军当晚在八罩岛过夜。次日（7月9日）郑军哨船发现清军已到花屿、猫屿一带，急忙向刘国轩报告。十六日（10日）施琅以速度较快的鸟船作为先锋，进攻娘妈宫。刘国轩令邱辉为先锋，由林升、江胜指挥水军出击，而他自己守在娘妈宫港口督战。
当时，海上风大，清军不敢全线出击，只有以蓝理为首的7只舰队突入郑军船寨。蓝理打得非常艰难，施琅又再派出第二波鸟船，加入战斗，但交战不久便遇上涨潮，水流很急，部分清军船只被海水冲向岸边。林升等率领的郑军趁势将舰队展开，分成两翼，意图包围清军。施琅见前方的鸟船战队十分危险，便亲自率船队突入郑军，力图救出蓝理等。不过，他的突袭被林升发现了，林升急率船队对施琅进行围攻。激战中，双方都有受伤，施琅被火铳射伤右眼，还好没有失明； 林升也被炮火打断左腿。林升负伤后，郑军顿时缺少指挥，施琅趁机突围撤离。
十七日（11日），施琅在返回八罩岛，这八罩岛地形很险恶，在台风季节非常危险，若遇到暴风，船只很容易被刮后撞击岛边的暗礁，幸好，那几日没有刮台风。刘国轩探知清军船队在八罩岛休整，他便亲自率船队去袭击，不过，刘国轩因为出师太急了，被有准备的施琅率军击退。施琅趁势于次日派战船攻取澎湖港外的虎井屿和桶盘屿。
施琅平台之战
二十二日（16日）早七时，军国几日休整后的清军船队，恢复了战斗力，施琅创新编组船队，公布严格的赏罚措施，决定对郑军发起总攻。施琅将舰队分成左、中、右三路，左路军共50艘船，由总兵董义等从澎湖港口西侧内堑攻入牛心湾，此路军意在让郑军误判清军要在此处登陆；中路军共有56艘船，分成8队，每队有7艘船，由施琅亲自指挥，作为进攻娘妈宫的主力；右路军共有50艘船，由总兵陈蠎等率队，从澎湖港口东侧东莳攻入鸡笼屿、四角屿，会同中路军从侧面夹攻郑军。此外，施琅还留下约80艘作为后备队，以备应急之用。
决战即将开始，可是，海面上突然刮起台风，受台风影响，海上吹起很大的西北风，这风向是施琅没有料到的。风势对郑军有利，刘国轩令郑军趁有利的风势猛攻清军，清军处于十分被动状态。清军船队将朱天贵被炮火打死，舰队阵营有些稳不住。
可是，到了中午，老天爷突然保佑清军了，因台风受赤道锋面带的影响，海上转而刮起南风，风向变得对清军非常有利。施琅见有了风势，立即令清军全面反攻。清舰顺着风势发射各种火器，围攻郑军船队，郑军被突然改变的风向弄懵了，原本就已贴近清军船队，风向一转，成了近距离的打击目标。激战了不久，郑军全面崩溃，郑军将领江胜战死、邱辉自焚，伤12000人，被俘5000余人；被毁、被缴的战船达190余艘。
刘国轩眼见郑军船队大溃败，知道战局已定，再也无力抵抗了，他急忙率着残余部队从北面撤往台湾，澎湖各岛余下的郑军，皆向施琅投降。此次决战，清军仅阵亡329人，伤1800余人，船只无一损失。施琅大胜。
鉴于台湾水道险恶，施琅没有乘胜对台湾发动军事攻击，而是采用各种“攻心术”。
施琅
首先，施琅在澎湖郑军归降后，禁止杀戮，发布《安抚输诚示》，安抚百姓，以稳定澎湖战后秩序；其次，施琅特意派人医治受伤的战俘，并配发给他们衣服、粮食，而后，再将痊愈的士兵送回台湾；再次，施琅指派原刘国轩的副将曾蜚赴台，劝说刘国轩归降，并拉拢郑军将领，劝其作为内应。此举果然有效，台湾军队防守淡水的何佑首先暗中与施琅联络，并劝说其他将领归降施琅。
其实，此时守在台湾的郑军人心全乱了，精锐部队在澎湖决战中全折了，战败消息在台湾越传越广，兵无斗志，民不安心。
关于下一步该怎么办，掌权的冯锡范和刘国轩出现了矛盾，冯锡范赞成有的将领提出的进攻菲律宾的建议，但遭到了冯国轩的极力反对，因为远征军只想抢劫，并想逃往海外，这是死路一条。
后来，在刘国轩的力劝下，延平王郑克塽于七月十五日（9月5日）向施琅投降，八月十三日，施琅率领舟师到达台湾，刘国轩等带领文武官员军前往迎接，并于八月十八日（10月8日）剃发易服，全心归顺清王朝。至此，郑氏王朝宣布正式灭亡。
战后巧妙安置，施琅力主设府管理，保留台湾
郑克塽降清之后，台湾已经被清军所控制，但是，朝中新的争论却展开了，关于台湾是否把台湾并入清朝的版图意见不一。朝中相当一部分大臣认为，台湾孤悬大海之上，朝廷若要安全防守台湾和把台湾治理好，要耗费许多银两，因而，倾向于主张将其弃守。
可是，也有一些大臣，特别是参与平台的大臣，主张将台湾纳入大清版图。以施琅为代表的这一派“纳台入版派”说服了康熙帝，施琅认为，台湾战略地位十分重要，而且，台湾资源丰富，是很美丽的岛屿，势必当纳入大清版图。其实，台湾原本就是中国的宝贵岛屿。
康熙二十三年（1684年）清廷在台湾设台湾府，下辖台湾、诸罗、凤山三县，设总兵官一员，兵八千；澎湖设副将一员，兵二千，台、膨隶属于福建省。从此，台湾和大陆在清朝又统一起来，其行政建制与内地划一。
施琅因平台有大功，授靖海将军，封靖海侯。康熙三十五年（1696年）施琅逝世，赐谥襄庄，赠太子少傅衔。施琅死后与其妻王氏、黄氏合葬。泉州城内有靖海侯府和施氏大宗祠。在同安东郊有绩光铜柱坊。
