“辅佐中兴，削平大难”“匡济艰难，辑和中外”——作为曾国藩得力弟子的李鸿章一直被清政府认为是这样的存在，所以在曾国藩镇压太平天国运动的时候，他自然也置身其中，只是曾国藩是几次三番和石达开这个狠人对上，虽败犹荣，李鸿章却因为“苏州杀降”事件，背上污点。
“苏州杀降”事件发生在1863年，先是太平天国领导层内讧，杨秀清被洪秀全杀害，之后洪秀全又猜忌石达开，导致石达开差不多是单打独斗，最终在6月份因为天降大雨渡河不成只能投降成全部下，以至于太平军实力一日不如一日，李鸿章得以接连拿下常熟、太仓、昆山、吴江、江阴，然后在11月进攻苏州。
在纳王郜永宽的指挥下，这8人做得很绝，11月28日瞒着谭绍光与清军谈判，谈判进行到12月2日，期间一直讲的要么是把谭绍光关着，要么就是活捉，结果12月4日八王却在谭绍光毫无防备之际，直接把他杀了，然后晚上就让清军入营，12月5日还全体主动剃发，不过他们不知道的是，这不过是李鸿章的“请君入瓮”。
由于李鸿章杀八王这件事从头到尾都没有告诉查理·乔治·戈登，戈登很是生气，因为他是英国派来和清朝一起镇压太平天国运动的统帅，当然英国镇压太平天国的目的并不单纯，他们是借机在清朝进行劫掠，李鸿章此举相当于剥夺了对方抢头等功，还有在苏州“发财”的机会，所以戈登站在道德制高点和李鸿章吵了一架。
李鸿章“夙知其忠厚可用”，不仅同意他创办上海洋炮局，让他和刘佐禹一起领导，成为中国近代史上第一位工业外籍厂长，还因为他让金陵制造局成为第一个引进西方技术和设备的厂，发展势头十分强劲，所以李鸿章多次上奏让清朝给他授官，将他地位一抬再抬，给他的薪水超级丰厚，还给他打造私人豪华别墅。
对于清朝包括后来的中国来说，马继业都是一个令人头痛的存在，1890年他到了新疆塔里木盆地，因为汉语很厉害，又知道中国礼节，获得了当地官员的信任，但他要来着信任想要做的却不是什么好事，作为一个骨子里留着大半中国血液的人，却筹谋着将大片中国的领土划入英属印度，就有了那一条“马继业-窦纳乐”边界线。
之后他还煽动、挑拨新疆和中央的关系，到处鼓吹所谓“独立宣言”，诱惑大批中国居民加入俄籍，还要英印政府出兵喀什噶尔，说什么要保卫英国的利益，以至于当时有个叫买买铁力汗的，发动不少人策划武装叛乱，幸好当地县长提前知道，当天将其击毙，但他造成的影响残留到了如今，马继业一次祸国殃民造成的影响也依然存在。
