1673年，年轻气盛的康熙帝认为时机已经成熟，于是抓住平南王尚可喜告老还乡的机会，正式下达了撤藩令。随后平西王吴三桂、平南王尚可喜、靖南王耿精忠纷纷上书，请求康熙收回成命。但康熙都予以了回绝，对于这次撤藩，康熙势在必行。
在明白了皇帝的决心后，吴三桂开始匆匆征兵备战。在此之前，康熙皇帝还一度以为三藩不敢公然叛乱，的确，尚可喜与耿精忠二人没有勇气起兵，但他算错了吴三桂这步棋。
虽然王朝覆灭，但是大明的人心与许多旧势力依然存在，明朝的几位藩王先后在南方称帝，农民起义军也不断揭竿而起。满清王朝面临的局势，可谓是一团乱麻。
于是这时明朝叛将吴三桂站了出来，他十分卖力的帮助清军在南方镇压起义军、打击南明政权。在他的剿灭下，西南诸省先后归于大清。国家统一后，顺治帝为了表彰吴三桂的功劳，将其封为异性藩王，藩号“平西王”，属地在云南贵州一片。
吴三桂虽然名义上是平西王，但其实势力范围已经达到了湘赣一带。他不仅能遏制云贵的地方督抚，还拥有任命四川广西等地官员的权利。
康熙二年，清廷收回了吴三桂的人事任免权，康熙六年，吴三桂又丧失了司法管理权。
不过这一系列看似严厉的权力削弱，并没有动摇到吴三桂的立身根本，那就是—兵权。
从开始立藩到吴三桂反叛，清廷每年都要发一大笔钱给各地藩王养兵息民。所以有“天下之赋，三藩耗其二”的说法，而吴三桂所在的云贵一带，耗费的银子最多。
答案是养私兵，这也是吴三桂凭借账面上三万多人的兵力就敢叛乱的主要原因。
吴三桂将云贵一带的财政收入大量地花在招兵买马上，不同的史料对吴三桂私人兵力的记载不尽相同，但是大致就在四到六万左右。
除了吴三桂外，另外两个藩王也早就有了侧反之心，只是苦于不敢做出头鸟。
在吴三桂势不可挡之时，他们终于坐不住了。1674年四月，靖南王耿精忠宣布与清廷脱离关系，1675年一月，平南王尚可喜正式发动兵变。此时也是“三藩之乱”的高潮时期，清军一路退守，南方十一省均失守。
1678年，吴三桂在称帝五个月后病逝。
1679年后，清军掌握了战场主动权，开始吹响反攻号角。1681年，持续了七年之久的“三藩之乱”以清军的胜利完整结束。
