尽管陆权的争夺在当时的欧洲极为盛行，但是欧洲的地理位置使得海洋依旧是影响各个国家发展以及国家之间关系的重要因素。
海盗活动于14世纪早期就有出现，在15—16世纪更是迅速发展。16世纪由于大国之间的海上战争不断，致使地中海上的海盗远比其他内海的海盗更加凶残。
尤其在17世纪以前，各国对其称为海上劫掠或海上行劫，这样的行劫和劫掠在一定程度上是合法的战争。例如，能提供正式的宣战声明或者武装私人船舶许可证等材料即可开战，“海上的行劫确有他的‘法律、规章，它的生动的惯例和传统’”。
这也为奥斯曼帝国和海盗间的联合提供了相对合理的条件。
海上的行劫也不仅限于地中海，柏柏尔人在地中海进行海上掠夺时还提及了英国、法国、荷兰等再大西洋上的海上行劫活动。
对于海上的行劫活动和劫掠也分为不同组织，有很多水手一直是依照旧时的海盗风俗习惯进行海上正常贸易活动，在听说他们自己被称为“掠夺者”、“海盗”的时候非常惊讶；也有一部分海盗，他们对于掠夺不分国家和信仰，只以此作为谋生的方式。
例如1536年8月一艘伊比扎船被劫掠，海盗们根本不去区分是来自法国的还是奥斯曼的船只，只为了抢走船上的猪肉。甚至在基督教或者是伊斯兰教内部的海运中，也发生过内部抢掠行动。
1593年，一艘来自法国的“浸礼会信徒让”号船只，带着西班牙驻南特代理人发来的通行证和批文，依旧被所谓的“多里亚亲王”没收、出售。
此外，还有一部分海盗，则是受到国家保护，其实所谓真正的海上行劫，“通常是在某个按照自身权利行事的或者只是勉强地附属某个大国的城市的怂恿下进行的。”
以国之名义进行正当合理的对外侵略扩张，大肆进行行劫活动，比起国家支付的高额佣金，获得赃物甚至都可以不计了。
对奥斯曼帝国与哈布斯堡王朝而言，海洋领地的划分以及海盗的猖獗对两者之间关系具有重大影响。
首先，对海洋领地的划分而言，欧洲各国与其他地区国家需要借助海洋这一媒介进行商业贸易及政治往来，尤其是在十四、十五世纪的欧洲，地理大发现使得航线成为各个国家最为宝贵的财富。
为此，奥斯曼帝国与哈布斯堡王朝对海洋权展开了激烈的争夺。
奥斯曼帝国本身为游牧民族，并不具备海上作战的传统，但在军事训练及武器装备的辅助下，奥斯曼帝国的军队在海上的表现依旧神勇，以至于其在勒班陀海战之中面对欧洲多个国家的联合攻势依旧占据上风。
各国也深知这条海上贸易线的重要性，刨除战争外也进行经济封锁，1578年菲利普二世颁布禁令，主要针对正在进行谈判的土耳其人，禁止那不勒斯和西西里进行海上行劫，使这条线路更加安全稳妥，从而吸引更多的船只，进而切断犹太人和土耳其人的货品、财物贸易运输。
此外，奥斯曼帝国的对外交往观念较为开放，善于在利益驱动下同他国进行合作，而不过分在意对方的身份，这使得奥斯曼帝国敢于与海盗进行交往，以期增强自身力量，对欧洲其他国家尤其是哈布斯堡王朝形成强大震慑。
早在15世纪，奥斯曼帝国就意识到了海盗群体的强大。在随后的几十年间，随着国力的不断壮大，苏丹有意和海盗进行合作。
到16世纪20年代末期，在巴巴利海岸至少有40多个海盗首领活动，在海雷丁的部署下袭扰基督教海域。而其中还有一部分海盗因为犯罪、被俘虏、或者对金钱的渴望而背叛了基督教，改信了伊斯兰教。
1525年，查理五世的决策更助长了海盗的势力，他批准了《阿拉贡净化宣言》，敕令里要求阿拉贡地区的伊斯兰教徒必须改信基督教，否则将被驱逐。
此时的巴巴罗萨海盗迅速向该地区的伊斯兰教徒们援助，大批穆斯林被海盗们运往马格里布，很多人都加入了海盗战争，或者向他们提供信息和攻击目标。
此时的海盗团反而成了他们的避难所，然而西班牙臣民却越来越频繁的被海盗所侵袭。而哈布斯堡王朝尽管始终为欧洲原住民，在客观上更具备海战的超强实力，但由于其王室风格较为墨守成规，使得海战中运用的战略战术较为单一，缺少变通，且对海盗势力始终持有鄙夷的态度，不屑与之进行结盟。
这也使得哈布斯堡王朝在与奥斯曼帝国的海上交锋中失却先机，进而使得奥斯曼帝国在并无优势的情况下依旧能够在海洋划分这一问题上与哈布斯堡王朝分庭抗礼，大大提升了奥斯曼帝国的综合实力以及政治、军事方面的威望。
其次，海盗肆虐对奥斯曼帝国与哈布斯堡王朝关系的影响主要体现在冲突与合作两方面。
冲突方面的影响主要是指海盗对奥斯曼帝国与哈布斯堡王朝所造成的威胁，使得两国需要分出部分兵力对海盗进行牵制，以维护自身的海上贸易以及帝国尊严，进而导致两国冲突形式的相对缓和以及休战、停战协定的达成。
就合作方面而言，海盗往往以结伙形式进行活动，并且具备一定的专业性以及较强的海上作战能力，这使得海盗群体得以形成一股力量，尽管其对各个欧洲国家造成威胁，但在一定情况下依旧可以与之签订条约加以利用。
奥斯曼帝国就是在一定程度上借助了海盗的力量，既对哈布斯堡王朝进行骚扰，也能有效提升帝国在海上的整体作战实力。
对于奥斯曼帝国而言，海军是整个帝国明显的一个缺点。大型海战一发生，苏丹便意识到这个问题，于是任命经验丰富，能力超群的海盗首领海雷丁为地中海舰队总司令。
苏丹还授予其总督席位并为其下设群岛行省，即奥斯曼帝国管辖范围内的地中海沿岸地区，进行实权的给予。
这一系列行为无疑加重了哈布斯堡王朝对帝国的敌意，使双方的斗争与冲突进一步加剧
，两大帝国之间的关系发展由此蒙上阴影，这也为未来双方关系的现实影响埋下了伏笔。
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