1195年，神圣罗马皇帝亨利六世派人前往君士坦丁堡，要求东罗马皇帝伊萨克二世向自己纳贡称臣。伊萨克二世知道东罗马帝国无力抗衡神圣罗马帝国的入侵，只得向亨利六世表示臣服。东罗马帝国一直以罗马正统自居，为何要向神圣罗马帝国屈服呢，船长为你细细道来。
一，腓特烈一世与伊萨克二世
1189年，神圣罗马皇帝腓特烈一世为了收复耶路撒冷，发起了第三次十字军东征。东罗马皇帝伊萨克二世担心腓特烈一世会趁借道之机攻占君士坦丁堡，所以对他十分提防，不仅拒绝为十字军提供补给，还在沿途对十字军进行小规模袭扰。但腓特烈一世无心吞并东罗马，所以对东罗马的敌对行为保持克制，寻求外交手段来解决问题，然后腓特烈一世与伊萨克二世通过书信进行谈判。
腓特烈一世因为东罗马称他为“德意志国王”而愤怒，声称自己是真正的罗马皇帝，于是带兵逼近君士坦丁堡，进行武力威胁。伊萨克二世无力阻挡十字军东进，只得向腓特烈一世求和，称呼他为“德意志皇帝”。随后双方和解，东罗马允许十字军自由穿越其国土，为十字军提供补给并对其损失予以赔偿。
二，神圣罗马迫使东罗马屈服
1190年，腓特烈一世在东征途中去世，其子亨利六世成为神圣罗马皇帝。亨利六世先于1194年征服西西里王国，控制了整个意大利半岛；然后把目光瞄向东罗马，企图迫使其承认自己为唯一合法的罗马皇帝。当腓特烈一世进行第三次十字军东征时，神圣罗马帝国就已经认识到了东罗马的软弱，因此亨利六世于1195年派出使者到君士坦丁堡，要求伊萨克二世向自己缴纳贡品。
伊萨克二世面临保加利亚人的强大威胁，需要神圣罗马帝国的援助，只得向其屈服，愿意向亨利六世缴纳贡品。但不久伊萨克二世就被哥哥阿莱克修斯三世推翻，遭到囚禁。但亨利六世依旧凭借武力迫使阿莱克修斯三世屈服，答应向他缴纳贡品。
然后亨利六世计划让整个欧洲向他屈服，让自己成为真正的普世帝国皇帝，但随着他于1197年的突然病逝，该计划未能实施。阿莱克修斯三世则意识到神圣罗马帝国的强大，放弃了“罗马皇帝”中的“罗马”二字，以表示无意与对方竞争。
三，东罗马皇帝臣服教宗
1204年，十字军在第四次东征时攻克了君士坦丁堡，还与威尼斯瓜分了东罗马，在东罗马故地建立了拉丁帝国等十字军国家。虽然拉丁帝国君主采用了皇帝头衔，自称“君士坦丁堡皇帝”。但拉丁皇帝为天主教徒，因此不仅向罗马教宗表示臣服，还承认神圣罗马帝国是真正的罗马帝国，神圣罗马皇帝是唯一合法的罗马皇帝。
1261年，尼西亚帝国皇帝米海尔八世灭亡拉丁帝国，收复君士坦丁堡，使得东罗马帝国复兴。然后米海尔八世就向神圣罗马帝国及教宗宣称自己是罗马皇帝，拥有独立于罗马教会以外的权利。很快米海尔八世认识到教宗对西欧的巨大影响力，决定获取教宗的支持，以避免西西里国王查理一世的入侵。
1272年—1274年，教宗额我略十世主持召开了第二次里昂大公会议。米海尔八世派人参加了此次会议，承认罗马教宗的至高无上地位，促成了东正教会与天主教会的统一。额我略十世因此承认了巴列奥略王朝统治君士坦丁堡的合法性，可东罗马民众却对此普遍不满，称米海尔八世成为了法兰克人。
1282年，米海尔八世去世，其子安德洛尼卡二世成为东罗马皇帝，迅速否定了东正教会与天主教会的统一。罗马教宗对此十分不满，想要发起新的十字军东征以迫使东罗马屈服，但始终未能成功。可14世纪末奥斯曼帝国的崛起，迫使东罗马皇帝再次向教宗求助，支持东正教会与天主教会的统一。但奥斯曼帝国于1453年灭亡东罗马帝国，使得东罗马皇帝与神圣罗马皇帝及教宗的争端结束。
总的来说东罗马帝国的衰落使其在与神圣罗马帝国争夺罗马帝国正统的斗争中处于劣势，被迫向神圣罗马皇帝及教宗屈服。13世纪中叶东罗马的短暂复兴也未能挽救其衰落，只得再次向教宗寻求和解。奥斯曼帝国的崛起更迫使东罗马依赖教宗的支持，在双帝争端中处于不利地位直到其灭亡。
