说起新疆近代史，“阿古柏之乱”是绕不开的历史事件，而“阿古柏之乱”的始作俑者就是阿古柏，此人凶狠残暴，滥杀无辜，从1865年至1877年，阿古柏带给新疆人民的是无尽的灾难。
阿古柏本名穆罕默德·雅霍甫，阿古柏是汉名，1820年，阿古柏出生于乌兹别克斯坦首都塔什干附近的一个村子里。其父伊斯迈特·乌拉，是个医生，同时也是个巫师，在村中负责替病人诵古兰经祈福。
只可惜阿古柏出生后不久，其父母离异，幼小的阿古柏跟随改嫁的母亲，这也是阿古柏悲惨童年的开始。
继父是个屠夫，性格暴虐，稍不高兴就对阿古柏的母亲拳打脚踢，幼小的阿古柏也常常遭受皮肉之苦。
没过几年，阿古柏的母亲就在一次意外中被凶残的继父殴打致死，失去了母亲的阿古柏逃离了这个家，沦落街头成为了一个孤儿。
当时阿古柏只有七八岁，因为相貌清秀，犹如女童，于是被街头艺人收留，阿古柏机灵聪明，很快就学到了精湛的舞艺。大约10岁的时候，他成为了一名“巴特恰”，也就是男扮女装的舞童。
娈童
在一次街头演出的时候，一名路过塔什干的浩罕（浩罕国是金帐汗国的乌兹别克人南迁后建立的国家，长期受到准噶尔蒙古的压迫。准噶尔之乱后，浩罕国曾短暂臣服于清朝，但因觊觎新疆领土，很快与清朝交恶。）官吏看中了他，将其买下来，收为自己的娈童，带回浩罕，并将其转送给穆罕默德·卡里姆·卡希卡，马达里汗的侍从官。
娈童，是当时社会一种极为恶俗的风气，一些达官贵人时常会挑选一些英俊的男童，来供自己猥亵，供他人消遣作乐。
年幼的阿古柏再次落入了魔爪，身心饱受摧残和折磨。或许正是因为童年不堪回首的记忆，让阿古柏的心理逐渐的扭曲变态，仇恨的种子被深深的埋藏下来。
冲出囚笼，成为霸主
1842年，马达里汗败于布哈拉汗国，战死沙场。布哈拉进占浩罕城，全国一片混乱。时任浩罕阿奇木伯克的卡希卡也加入对汗位的角逐中，但不幸失败丧命。趁着内乱，
阿古柏冲出囚笼，逃到家乡投奔塔什干。
阿古柏有个同母异父妹妹，也就是屠夫继父和阿古柏母亲生的孩子，继父死后，妹妹找到了回到村里的阿古柏，为了巴结当地武装头目伯克纳尔·穆罕默德·库什，狠毒的阿古柏将年轻漂亮的妹妹献给了库什，由此阿古柏成了库什副官。
不久以后，库什任命阿古柏五百人长（军中职务），负责打击塔什干境内的哈萨克人叛乱分子。阿古柏充分展示了自己骁勇善战的军事天赋，此后屡立战功，官职也是越做越大，1860年前后，阿古柏晋升为阿克麦吉特（今纳罗夫斯基地区）伯克（官职），不仅拥有自己的军队，而且队伍逐渐壮大，此刻的阿古柏，已今非昔比，已经成为雄霸一方的诸侯，势力不可小觑。
分裂新疆，成立“洪福汗国”
1864年，新疆发生叛乱，库车、和阗、喀什、吐鲁番等地先后建立了地方武装割据政权，新疆处于混乱之中。
1865年，45岁的阿古柏拥护号称“圣裔”的布素鲁克，布素鲁克的曾祖父是大和卓，新疆土著，当地的伊斯兰教领袖。大和卓和弟弟小和卓两人搞了一次武装叛乱，叫“大小和卓叛乱”，只是造反不成，被清军镇压。
1867年5月，随着战争的不断胜利，阿古柏觉得不再需要傀儡布素鲁克，于是宣布取消“哲德沙尔汗国”，随即建立“洪福汗国”，自封为“ 巴达吾来特哈孜 ，即汉文史籍上的“ 毕杜勒特 ”。
勾结英俄
1868年，英国派遣特使会晤阿古柏，承认其政权，次年，阿古柏也派亲信米尔扎·沙迪赴印度会见英国总督，争取英国支持。英国决定向其赠送大批军火，并允许其在印度招募工匠回喀什设立军工厂。
1870年，俄国也派人前往喀什会晤阿古柏，承认其政权。
阿古柏随即派遣阿吉托拉回访圣彼得堡，并访问奥斯曼帝国。身兼教领袖哈里发的奥斯曼苏丹阿卜杜勒·阿齐兹封阿古柏为埃米尔，并派遣军事教官去喀什，此举使“洪福汗国”在教法上获得了合法地位。
手段残忍，滥杀无辜
或许是童年时遭受到非人对待，阿古柏性格极其变态，做事手段残忍，经常滥杀无辜。
1865年，阿古柏清军守备下的喀什汉城，清军守备何步云投降献城，喀什噶尔参赞大臣奎英举家自杀，阿古柏进城之后，对所有不愿改奉伊斯兰教的汉人全部杀光。其后，对于信奉佛教的汉人，阿古柏的政策就是一律斩尽杀绝。
阿古柏动辄屠城，据记载和田地区就有5万民众被杀害。阿古柏纵容军队对百姓进行烧杀抢掠，致使许多村庄十室九空，尸横遍野。
多行不义自毙
1875年，在左宗棠的率领下，清军进入新疆，收复新疆之战开始。到1876年底，阿古柏已经失去了北疆的所有领土。就在清军开始南下之时，阿古柏突然于1877年5月29日死于喀拉沙尔（新疆焉耆县）。
纵观阿古柏的一生，童年时遭受不幸，再后来飞黄腾达成为“大汗”，只是他性格暴虐，残忍至极。
中国有句古话：“犯我中华者，虽远必诛”，阿古柏的下场恰恰验证了这句话。
