年羹尧作为雍正朝的核心人物，自然是被雍正所倚重的，视其为社稷重臣。虽然年羹尧远在西北边陲，但是雍正却是经常让他参与朝政大事，但凡军国大事以及官员的升迁都要采纳他的意见，此举来说雍正对于年羹尧不可谓皇恩深重。
在山西巡抚诺敏向雍正提出火耗归公的意见之后，雍正就向年羹尧询问：朕对于此事不是特别了解，不好判断正确还是错误，想听一下你的建议。律例馆修订律例之后，雍正在阅读之后也会发给年羹尧要他提出一些修改建议。
当然在任用官员的方面，雍正也给年羹尧特别大的权力。在川陕，文官方面从督抚到州县，武官方面从提镇到千把，这些官员的升降都可以由年羹尧一人拍板决定。不仅如此，对于其他地方官员的任命，雍正也会经常听取年羹尧的意见。
比如京口将军何天培的作风操守，朝中以及内外对于其的评价各不相同，于是雍正就让年羹尧据实上报然后再决定其去留。还有就是年羹尧上奏雍正说直隶巡抚赵之垣庸劣纨绔，于是雍正便将赵之垣革职。再江西南赣总兵出现空缺的时候，朝廷曾准备启用宋可进，但是由于年羹尧上奏称宋可进不能胜任，请求启用黄起宪，于是雍正就听从了年羹尧的建议。除此之外，雍正还经常在群臣面前夸赞年羹尧为肱股之臣。
雍正对于年羹尧寄予厚望，当然年羹尧也，没有辜负雍正的期望，为雍正朝做出了不朽的贡献。正是因为如此，在雍正初年，年羹尧确实是受到了雍正的信任与重用，当然也得到了雍正的赏赐和恩宠，不仅是他自身加官进爵，连他的家属以及奴仆也受到恩宠。
雍正对于年羹尧赏赐也是经常的事情，有一次雍正赏赐给年羹尧荔枝，为了保鲜，命令驿站要6天从京师送到西安，此举可以与唐朝时向杨贵妃献上荔枝相提并论了。这样看来雍正对于年羹尧的宠爱提到了很高的地位，但是雍正也没有察觉到这样宠爱是比较危险的，这也为年羹尧最后的悲惨结局埋下了伏笔。
话说物极必反，做人也是如此，一旦违反了自然规律自然是会走向反面的。年羹尧被眼前的辉煌业绩以及雍正对于其的宠爱，一天天自我膨胀起来，不知道自身的处境是越来越危险，这渐渐地就引起了雍正的反感。
年羹尧渐渐地妄自尊大，不恪守臣道。在四川，年羹尧擅自把康熙的行宫当做了自己的中军营帐，而且每天还有1000多人为他运送蔬菜，吃饭也居然称之为“用膳”。在大军之中，蒙古的诸王，见了他必须下跪；对于朝廷派来的侍卫 ，他也威逼利诱，供他驱使。
按照清朝的制度，但凡上谕到达地方，地方大员必须迎诏，并且行三跪九叩大礼，跪请圣安。但是雍正帝的诏书两次到达西宁，年羹尧竟然不行礼，直接让宣读。还有年羹尧与督抚和将军的来往咨文中，常常模仿皇帝的口气，擅用令谕。年羹尧曾向雍正上呈其出钱刻印的《陆宣公奏议》，雍正准备亲自撰写序言，但是年羹尧却以怕打扰雍正为由，自己撰写序言，这样地僭越，自然引起了雍正的反感，也令雍正寒心，此时他就仿佛变成了康熙朝的吴三桂。
在雍正二年十月年羹尧进入京城的时候都统范时捷、直隶总督李维均跪下迎接，到达京城时，在郊外迎接的王公以下官员跪下迎接，年羹尧却坐在马上都不看一眼，王公大臣向他问候，他也只是点点头而已，可见年羹尧的狂傲。
在京城时，他外出之前，下令百姓关门停业，别人给他送礼称为“恭进”，而他给下属的东西竟然称之为“赐”，接见下属称为“引见”，这都是皇帝对待臣子的说法。而且他在雍正面前也是十分地傲慢无礼。
年羹尧还接受贿赂，私吞军饷，除他的亲信之外，别人走其后门都需要孝敬他厚礼，多的可以达到2万两，仅仅人事安排最多一次就收受40万两白银，那会一品大员一年的俸禄才180两银子。由于他常年在外统兵，侵吞银两达100多万两。
他还排除异己、结党营私，在保荐官员的时候，由他保荐的人都称之为“年选”，连吏部和兵部也得看他的脸色，这样一来，年羹尧就把自己放到了十分孤立的地位，造成了天怒人怨的地步。而且年羹尧还把自己的亲信安插到了朝廷的各个要害部门，这自然就引起了雍正的警惕。
张廷玉曾评价：朝廷本来就是用年羹尧来攘外，现在外患已除，年羹尧还不知道收敛，离死期不远了。自古以来，功高盖主的人最应该韬光养晦，并且逐渐功成身退才是最好的选择。但是年羹尧却不退反进，居然想把十万大军培养成自己的私人武装，又想插手地方的事务。年羹尧这样的举动让一般的皇帝都无法容忍，更何况雍正这样的铁腕皇帝。
年羹尧在收到雍正的朱谕：凡人臣图功易，成功难；成功易，守功难，……。至此年羹尧便不再得到雍正的信任，他的处境也急转而下。还没有等年羹尧反应过来，雍正便向有关官员打招呼，让其检举揭发年羹尧的罪状，为铲除年羹尧开始做准备，也开始铲除其之前安插的亲信。雍正想不到自己最信任的、最重用的人，却是辜负他的人。
雍正三年，对于世界是平凡的一年，但是对于清王朝来说却是异乎寻常的一年。在这年的二月，出现了奇怪的星象，太阳还没有落下月亮就出来了，并且正好赶上金木水火土五星连珠，这种现象可能需要一两百年才会出现一次，所以被认为是大吉大利。百官纷纷上奏祝贺，年羹尧也上书，但是他用了一个词“夕惕朝乾”，本来这个词是“朝乾夕惕”，这一下就让雍正抓住了把柄。
雍正先将其亲信甘肃巡抚胡期革职，让四川提督纳泰调回京城，使其无法作乱。之后便解除年羹尧川陕总督职，让年羹尧交出抚远大将军印，调任杭州将军。年羹尧一开始找借口不愿意前往，到杭州后仍然不思悔改。
到了这个时候，各地官员都看清了形势，纷纷揭发年羹尧的罪状，最后经过朝廷审议，给年羹尧列出了92款大罪，有人说其中有些罪名是强拉硬扯上的。一个曾经被皇帝视为手足的重臣最后落到了这步田地，真是令人唏嘘。雍正念及其青海的战功，最后赐他在狱中自裁，当然算得上是皇恩浩荡。年羹尧在狱中墙上咬破中指写下“狡兔死，走狗烹”，最后自裁。
年羹尧父兄族中有任职的均被革职，他的儿子被杀，其他15岁以上的嫡亲子孙都被发配充军，至此叱咤风云的年大将军以这样一种结局结束了自己的一生，年仅47岁。
