亚历山大北征的目的，到这个时候可以说是完全达到了，在时间上也配合得很好。他以极快的速度穿过了巴尔干半岛的主脉，不到两个星期，亚历山大的大军已经迫近底比斯了。面对险阻的山道，装备笨重的马其顿军队居然可以每天在崎岖不平的羊肠小道上行军三十公里以上。
根据常识，这是难以实现的速度。当底比斯的民众们第一次看到亚历山大出现的时候简直不敢相信。当他们辨认出那是千真万确的事实时，这才感到和解的希望全没了。这时他们也觉悟到已经面临绝望的命运。经过国民大会的商量之后，他们决定要为了自由奋战到底。
底比斯的全体市民，连同奴隶、外国人都拿起武器，为保卫底比斯做最后的奋战。从他们这次全民皆兵的举动来看，底比斯确实是抱着宁为玉碎、不为瓦全的决心。尽管如此，底比斯的攻陷现在只剩下时间的问题而已。虽然底比斯人众志成城，英勇奋战，可是还是无法抵抗亚历山大的攻击。
到了最后，亚历山大终于攻入了底比斯城，不分男女老幼，一律屠杀掠夺。底比斯城内到处都是尸体，堆积得像山一样的高，即使是躲在神殿中的老人和妇女们也被士兵们拖出来，有的被杀，有的被殴打，有的被施以暴行。根据史书记载，底比斯被屠杀的种种惨况简直是人间地狱。
最后，底比斯被夷为平地，浩劫之后残余的人们也沦为奴隶。马其顿的士兵对底比斯城的破坏可以说是非常彻底，连一草一木都不能幸免。这一次大屠杀的时间只不过是一天，可是这一天的血雨腥风足令天昏地暗!这就是亚历山大恩威并施、杀鸡儆猴的做法，使其他的希腊诸国都噤若寒蝉，不敢再支援底比斯。
他将这一次战役的罪魁祸首的命运交给同盟会议去决定，让希腊人自己去判决这些人。这可以说是非常讽刺的做法，亚历山大给予希腊人很大的难堪。对于希腊人，这也是一个非常棘手的问题。
