蒙古军队远道而来，不仅粮草缺乏，而且难以抵御刺骨的严寒。阿合马汗只得下令撤兵，等来年再作打算。但是还没等到来年的夏天，阿合马就在一场内讧中被杀了。从此，蒙古人再也没有足够的力量来镇压罗斯人的反抗，罗斯人民终于在遭受异族统治200多年后赢得了独立，获得了新生。在基本统一俄罗斯并摆脱了蒙古人的统治以后，伊凡三世开始建立中央集权的国家制度，构筑一个比较完整的罗斯国家统治大厦。伊凡三世在1472年同拜占廷帝国末代皇帝的侄女结婚，于是便称自己是帝国的正统继承人。他用拜占廷帝国皇室的徽号——双头鹰作为自己国家的徽号。
他还为自己特制了一顶皇冠，每逢召集王公大臣们开会时，他便端坐在一张镶满宝石的靠椅上，要他们先对自己顶礼膜拜，并称呼自己为“俄罗斯君主”。有了富丽堂皇的座椅和皇冠，伊凡三世觉得宫殿和整个莫斯科建筑太土气了，这与自己的身份、地位不符。于是他请来包括意大利著名的建筑师菲奥拉文梯在内的许多建筑师和工匠，在莫斯科设计并建筑了一座圣母升天大教堂。这座大教堂前后花了5年时间才完成，后来成了莫斯科市的标志性建筑之一，每年的8月27日或28日，俄罗斯的东正教信徒们都聚集在此，纪念圣母玛丽亚“升天”。
除大教堂外，还兴建了一座华丽的宫殿、高几十米的大钟楼和其他教堂。从此，莫斯科真正成了俄罗斯的文化和宗教中心。伊凡三世通过控制宗教活动来进一步巩固自己的地位，这些建筑形象地向世界昭示了莫斯科公国的雄起。为了更好地进行管理，伊凡三世把许多臣服于他的王公和贵族召到一起，组成“波雅尔杜马”，为自己出谋划策，共同治理国家。“杜马”在俄语中是“会议”的意思，后成为国家的最高权力机构。在统一和独立的过程中，伊凡三世深感军队的重要。他建立了一支庞大的常备军，由自己担任最高军事统帅，改变了过去单纯依靠领主家兵的状况，增强了国家的军事实力。
他命令所有贵族都必须服兵役，并且要自备马匹和装备。碰到打仗时，各庄园主也要率领家兵奔赴战场，和常备军共同作战。1497年，伊凡三世颁布了俄罗斯历史上第一部法典。法典规定，如农民想从一个地方搬到另一个地方，只有等秋后所有农活都结束后，在国家指定的日期——旧历11月26日那一天，才能获准离开，迁走之前，还必须向主人缴纳一笔叫“居住费”的房租。至于要缴多少，全由主人自己决定。这条法规使得许多农民因缴不起高额的“居住费”而被迫为原主人卖命。如果农民擅自迁移，一旦被主人抓到，将受到鞭打甚至被杀头。
这使农民实际上成了失去自由的奴隶，因此，他们被称为“农奴”。“农奴”制度的存在严重束缚了俄国经济的发展。法典还制定了中央和地方行政管理制度，奠定了专制制度的基础。此外，他还设立国家税务机构，取消了大贵族的征税特权；他对酿酒等垄断经营；他还统一货币，垄断了铸币权。这些措施增加了国库收入，提高了国家的经济实力。在伊凡三世统治时期，以农奴制为基础的俄罗斯中央集权国家逐步建立起来。到伊凡三世65岁去世时，俄罗斯已以一个封建强国的面目出现在欧洲乃至世界的舞台上。
