1908年11月14日，光绪皇帝驾崩，三十八岁的他没有留下一个孩子。通过太后慈禧同意，立了醇亲王载沣的儿子溥仪为皇帝，年号宣统。慈禧成为了太皇太后，而她这太皇太后也不过是当了一天，11月15日未时（下午2时左右），慈禧在她的中南海仪鸾殿病逝。享年七十四岁，临终时慈禧说：此后，女人不可预闻国政。不过她这时都已经干政大半辈子了，事实上清朝也没有几年了。
宣统元年（1909年）十月，慈禧被葬在清东陵。生前，慈禧喜欢的金银首饰数不胜数，她去世了，这些珠宝自然也得跟着她去。根据《爱月轩笔记》记载，先是在棺底铺一层金花丝褥，上面都是珠宝。接着再放上一层薄褥，接着把慈禧的遗体放进去，头顶是翠荷叶，脚下是碧玺莲花。慈禧的身上穿着金丝串珠彩绣礼服，外罩绣花串珠挂，各种珠宝堆在她的棺材里，其中嘴里还含着一颗稀世夜明珠。
这颗夜明珠根据专家研究，是阿富汗的一位国王八次远征印度，随后从莫卧儿王朝抢来的莫卧儿大帝金刚石。在1760年或者是1762年将这个宝物上贡给乾隆，最后一直在清室的手里，才因此去了慈禧的嘴里。这颗夜明珠重四两二钱七分（合今133.4375克），而慈禧陵墓如此的豪华，自然会引起别人的觊觎。
1928年7月，孙殿英就以军事演习为名义，盗了清东陵慈禧还有乾隆的陵墓。将这两座陵墓洗劫一空，慈禧嘴里的那颗夜明珠也被他拿走。这事在当时引起很大的轰动，清宗室和溥仪都在讨要说法，但最后孙殿英被放过了。因为他将许多宝物都拿出来打点，其中那颗夜明珠被送给了宋美龄。
根据孙殿英的描述，慈禧夜明珠分开是两块，合起来就是一颗圆球。而分开的时候是没有光的透明状，但当合拢之后就会发出绿色的光芒，在百步之内都能看见。这颗夜明珠不知道是什么材质，莫卧儿大帝金刚石也是根据种种史料推测出来的。《慈禧陵墓被盗案》一书推测在当时价值起码有一千零八十万两，但后来有收藏家估计，价值起码翻了十倍。民国后期又有估计，最少涨了百倍。到了现在，恐怕价值八亿都不止。
宋美龄还比较喜欢这个东西，但到底是含在死人嘴里的，所以她就用来分开镶嵌在了鞋子上。重要场合出席的时候，耀眼无比，但后来这颗夜明珠就不知所踪了。有一个说法是，应该是被美国富商洛克菲勒买下。宋美龄经常出入美国的上流社会，主要是为了求得援助。在这样的社交场合，穿那双夜明珠的鞋也是正常的。洛克菲勒看到后就想买下，因其能够提供物资，所以宋美龄答应了。
随后就被收藏在了他的家中，洛克菲勒去世后应该是由其家人继承。显然，还回来是不太可能的，毕竟人家是用东西进行了交换的。除了这颗，慈禧凤冠上的九颗夜明珠也很有名。其中的四颗本来是要送给外国人的，但被一个王姓的宫女藏了起来，在六十四年后的1964年才被人们所发现。不过这四颗比嘴里的那颗要小，大概是龙眼大小，1985年还发现过另外两颗。
