在清朝，总督这个位置是很重要的，可以说，总督督抚所形成的督抚制度是整个清朝政治制度之中最关键的一环。早在明朝的时候，督抚就已经存在了，不过最初的时候，这个官位的权力并不大，只不过是一个临时性的差遣官而已，到了后来成为了常设的地方官，直到清朝才成为了掌管地方军政要务的封疆大吏。
总督这个职位在清朝到底有多重要呢？可以说，这个督抚制度在一定程度上维护并且发展了清朝的中央集权的皇权制度。在清朝最开始的时候，几乎每个省都设置了一个到多个的总督，形成了“因事设置，随地分并，员额多寡不一”的局面。
在顺治朝的时候，总督的设置和最开始一样，就是个临时的差遣官，很多总督把事办完之后就被撤下来了，可以说在总督这一个官位上，顺治帝很任性了。那个时候全国一共有十五个总督，分别是直隶总督、山东总督、江南总督、山西总督、河南总督、陕西总督、福建总督、浙江总督、江西总督和湖广总督，也就是说其实在顺治帝的时候，山西、河南和山东是有总督的，所以不能够说清王朝没有在山西、河南和山东设置总督，最早是设置了的，只不过后来被撤销了而已。
顺治五年的时候，国家设置了直隶山东河南总督，但是顺治五年的时候因为种种原因，直隶山东河南总督被裁，变成了直隶巡抚。
清康熙时期，国家趋于稳定，所以这个时候的总督就从临时差遣逐渐变为了固定官职，而康熙朝这个制度就有了两次的大变动，康熙四年，也就是公元1665年的时候，先进行了一次大裁员，贵州的总督裁并到了云南，广西的总督裁并给了广东，江西的总督裁并给了江南，而山西的总督则是裁并给了陕西，也就是说在这次的裁并中，我们的山西总督彻底卸任了。而直隶、山东和河南这三个地方只设置了一个总督，总管这三个省。
但是上文说到了顺治时期已经裁了一次山东河南总督，哪里又来的总督给并呢？康熙四年的时候，康熙帝再次设立了直隶山东河南总督，任命朱昌祚为总督，但是一年之后朱昌祚得罪了鳌拜，被鳌拜用假圣旨赐死。康熙八年鳌拜获罪，而直隶河南山东总督这一官职再次撤销，这一撤销就到了康熙五十六年。之后的清朝虽然再次设立了直隶总督，但是河南山东不再被特别点出来。
直到乾隆二十五年，全国的总督设置开始固定，在乾隆朝之后的隆庆、道光和咸丰三朝总督设置几乎没有什么变化，于是就形成了我们现在所熟知的八总督格局。分别是直隶总督、两江总督、陕甘总督、浙闽总督、湖广总督。四川总督、两广总督以及云贵总督。至于山西、山东和河南的总督不再特别设立，成为了清朝政治史上的一个过去式。
