太平天国后期，封赏泛滥，据统计，洪秀全一共封了2千多个王爵，其他官职更是不计其数。但唯独有一个官职，却不轻易给人。纵观太平天国十四年风云历史，担任过其职位的仅有13人，这个职务就是军师。
说起军师，我们第一时间想到的恐怕是姜子牙、诸葛亮、张良、刘伯温这些运筹帷幄之中，决胜千里之外的谋士。但太平天国的军师却和上述这四位军师不太一样，除了诸葛亮身兼部将、丞相、统帅职能于一身外，其余三人更像是智囊，为君主提供决策建议。
太平天国的军师不一样，他既是官，也是职务，地位处于万人之上，仅次于天王洪秀全一人。
1951年永安建制，太平天国首次封王，圈定了以天王、军师为核心的统治层。洪秀全、杨秀清、萧朝贵、冯云山、韦昌辉、石达开,为太平天国首义六王。除了洪秀全以外，其余五人封赏如下：
今特褒封左辅正军师为东王,管治东方各国;褒封右弼又正军师为西王,管治西方各国,褒封前导副军师为南王,管治南方各国;褒封后护又副军师为北王,管制北方各国;又褒封达胞为翼王,羽翼天朝。以上所封各王,俱受东王节制。
在这次封赏里我们看到，东王杨秀清、西王萧朝贵、南王冯云山、北王韦昌辉等四人除了封王以外，还担任了正副军师一职。但地位尊崇如石达开，也未能获得军师一职。这充分说明了军师的地位是很高的，授军师者必是王爵，封王未必受封军师。
在《天王诏旨》中提到:“总制次递达丞相,丞相达军师,军师转奏。”1853年公布的《天朝田亩制度》即记有“军师奏天王,天王降旨,军师遵行。”军师是只对天王一人负责，其他人对军师负责，意见和命令需要通过军师才能转奏和执行。
在太平天国早期，军政大权由几位军师掌握，尤其是东王杨秀清，“以上所封各王,俱受东王节制”，杨秀清事实上成为了军政的实际负责人。
由于军师的权力过大，甚至出现了许多太平天国的百姓、底层士兵只知有东王而不知有天王的现象，甚至连清廷也认为没有洪秀全此人，他是杨秀清为了迷惑人心而编造出来的神话中的人物。
杨秀清除了担任东王和军师外，在太平天国的宗教理论中还是天父的代言人，过高的威望和政治权力造成了他个人权力欲望的膨胀，引起了洪秀全的猜忌，并最终导致天京内讧的发生，杨秀清被杀害。
经过此事以后，洪秀全也认为到了军师权力过大会对天王地位和威望产生威胁。因此天京事变后的两年里，军师一职由洪秀全自己出任，所谓“主是朕做，军师亦是朕做”。即使是帮他消灭杨秀清的功臣韦昌辉、战功赫赫的翼王石达石，都未能获得军师的封号，仅仅是副军师。石达开一定程度上也是因为未能获得军师封号而感觉自己深受洪秀全猜疑，不得已带兵出走，转战全国。
为了制衡军师的权力，洪秀全对太平天国的官制进行了改革，建立了处理日常政务的六部。
在天京事变之前，太平天国虽设有天官部、地官部、春官部、夏官部、秋官部和冬官部,对应传统的吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部，还有配合六部制的内阁大学士。但这些部的负责人丞相事实是各王府从事文书工作的人，也就是说丞相对王爷负责，所对应的部也由对应的王府负责管理。
通过洪秀全的改革，提升了六部丞相的地位，他们不再是王府的附庸，而是在相应的部中从事管理工作，六部也成了天国中负责实际事务的具体管理部门，对洪秀全负责。
因此后来洪仁虽然也被封为军师，“天王降旨,军师宣列王,列王宣掌率以下官,一体遵行”，地位在陈玉成、李秀成之上，但当安庆失陷时,即不间青红皂白,立即革职。因为此时的军师只是代天王理政，具体的朝政事务已由中央六部完成，军师的地位已大大降低。
通过改革六部和降低军师的地位，洪秀全成了太平天国真正的领袖，他不需要再像之前那样受到杨秀清的掣肘。
他可以根据自己的喜怒，随意封赏和处罚隶属他的任意一个人。即使陈玉成、李秀成等“外带兵之将,日夜勤劳之人”，也无力抗衡，一有错误，就不问青红皂白，革职查问。
