原先的准噶尔仅是卫拉特蒙古部落联合的一部分。但在1646年的时候，卫拉特蒙古的各个部落都归顺了清朝，而此时的准噶尔却慢慢迁移到西域地区，并且确立了对该地的统治，所以准噶尔与其他蒙古部落不同，它并没有归属清朝。
1690年，准噶尔的领袖葛尔丹正式入侵已经被清朝掌控的喀尔喀蒙古，之后康熙迅速调派大军围攻准噶尔汗国，两国长达70年的战争自此开始。公元1758年，准噶尔彻底被大清王朝挫败，成为了其国土的一部分。
而康乾时期，准噶尔汗国那么难打的原因并不难理解，无非就是因为它是一个拥有完善体制的割据国家，而且还拥有地理上的优势。
虽然当时清军有着绝对的军事优势，但这个优势在准噶尔国土上却有些相形见绌。清军想要远征西域，必须翻过万水千山，而由于对当地地形还不熟悉，他们经常会遭到准噶尔军队的伏击。
再加上气候方面也不适应，清军虽然作战英勇，但“客场作战”的他们能够发挥出来的战斗力却是极其有限的。更别说他们还要面对战线逐渐拉长，后勤补给严重不足的大问题。
当然最为重要的原因，还是准噶尔背后有沙俄的支持——早在十八世纪，沙俄就把领土扩张到了西伯利亚，所以它与准噶尔汗国之间一直有所勾结。
对于沙俄来讲，他们并不愿意看到大清王朝继续向中亚地区扩张，毕竟在自己所设定的计划里，中亚、东亚地区都至关重要，因此它一直都在背后给准噶尔汗国提供各类资源上的支持。
正是在这一系列因素的干扰下，最终使得清朝经历了康熙、雍正、乾隆三代帝王才统一新疆，将准噶尔汗国从地图上彻底抹掉。
毫无疑问新疆统一战争，是一场非常典型的反对民族分裂的战争，它的过程虽然艰难，但结果是好的，沉重打击了沙俄试图侵蚀我国新疆地区的尝试。
只是在一百多年后，左宗棠收复新疆的时候，这一地区的局势已经发生了根本性变化。鸦片战争爆发后，中国逐渐沦为半殖民地半封建社会，以英国、法国、俄罗斯为首的欧洲列强不断侵占我国领土，而沙俄的主要方向依旧还是新疆。
当时在英国、沙俄的背后策动之下，新疆地区不少土地都脱离了清王朝控制，建立了亲近于西方国家的地方政府，甚至在某一段时间，我们已经失去了对于大半个新疆的管辖权。
所以在1876年的时候，也就是清朝的光绪二年，左宗棠受命收复新疆。而他也不负众望，仅仅只用了一年的时间就解决了新疆问题，巩固了清王朝对新疆边境的统治。
——康雍乾三位明君，用了整整70年才解决的问题，左宗棠却仅用了一年，这显然和当时的局势变化有着直接关系。
首先左宗棠收复新疆的时候，这片土地上并没有出现像准噶尔汗国这样强大的国家。那时的准噶尔汗国已经建立了基本的统治体系，有完全属于自己的政府、军队、财政和外交。
而清朝末期，逐渐脱离中央统治时的新疆，却已经陷入到严重的分裂状态，他们本身存在很大分歧，所以左宗棠完全可以通过各个击破的方式，去解决这些叛乱势力。
而且尽管这些分裂势力得到了英国、沙俄的支持，可问题是英国、沙俄并不是穿一条裤子的，他们在新疆问题上有着截然不同的态度。
——沙俄不愿意看到英国势力范围蔓延到中亚地区，而英国则一直想利用阿富汗作为跳板，试图进入沙俄的“后花园”，所以英国和沙俄之间的争斗从来没有停止过，他们都试图在我国新疆扶持自己的利益代言人，这也给了左宗棠机会。
再者，左宗棠自己也确实是一个优秀的战略指挥家，他从一开始就制定了先北后南、缓进急战的战术。
1876年的8月，左宗棠的西征大军攻克今天新疆的米泉，还成功收复乌鲁木齐。尤其是后来在一次战役中歼灭了超过5000名地方土邦叛军，这使得其名声威震整个新疆。之后在1876年11月，左宗棠所率领的西征大军攻破了玛纳斯，彻底平定新疆之乱。
最后在新疆局势已定的情况下，清朝专门派曾纪泽前往沙俄与他们进行公开谈判，此时英国在中亚地区的争夺中已经处于劣势，所以对清王朝也表示支持。因此沙俄迫于压力，最终在1881年2月24日同清王朝签订了《中俄伊犁条约》，这则代表沙俄势力完全退出新疆一带。
