顺治作为大清入关的第一位皇帝，其婚姻带有浓厚的满族早期婚姻的特点，这主要表现在他与四位皇后除夫妻意外的复杂关系上。这四位皇后分别是废后博尔济吉特氏、孝惠章皇后、孝康章皇后、孝献皇后。下面具体来讲一讲这四位皇后的不同命运。
第一位皇后是博尔济吉特氏，她是孝庄的侄女，科尔沁蒙古亲王吴克善的女儿。顺治八年，14岁的顺治帝在太和殿举行了第一次大婚。但大婚之后帝后感情不和，仅两年顺治帝就提出了废后重立的问题。他的理由是“生性妒忌，每见貌少妍者，即憎恶，欲置之于死”、“又好奢华，凡诸服御，莫不以珠玉绣缀饰”。
其实这些理由都是托辞，促使顺治帝要废掉皇后的实质原因，根子还是出在多尔衮和孝庄身上。因为这个皇后是多尔衮执政时为他选的，目的是为了促进与蒙古的关系，而孝庄也有心让娘家人主持后宫。也就是说，这场婚姻是典型的政治婚姻，与顺治帝的本人意愿极不相符。
尽管如此，但顺治帝十分清楚，废立皇后是朝中大事，不好轻举妄动。他先投石问路，命大学士给他找出前代废后的事例，以观察朝臣的反应。
果不其然，顺治帝的废后意向很快遭到了朝臣的反对，他们从封建伦理道德出发，认为皇后“母仪天下，关系甚重”，还搬出历史上有名的贤君，如光武帝、宋仁宗、明宣宗，他们都因废后而受到后世的指责。另一方面，朝臣也担心入关不久，统治地位还不牢固，废后之举不是开国之君所为。
顺治帝年少性格急躁，他执意要做的事情别人很难阻挡，不过他也做出了让步，他下令将皇后降为静妃，改居侧宫。后来博尔济吉特氏返回了蒙古草原，并死在了娘家。
废后不久，朝中开始为顺治帝择立第二位皇后忙碌了。当时顺治帝的后宫虽不乏嫔妃，但他认为没有一个能配得上皇后的称号。因此，他下旨在满洲官民、蒙古王公、大臣以上女子中选择皇后。候选人成千上万，最后还是选定了科尔沁蒙古镇国公绰尔济的女儿博尔济吉特氏，她是废后静妃的侄女。
顺治十一年六月十八日，顺治帝在太和殿举行了盛大的婚礼，迎娶了他的第二位皇后。可是，婚后不久，顺治帝又开始挑剔新立的皇后，说他虽然“秉心淳朴”，然而却“乏长才”。他让礼部收回皇后的册宝，停止对皇后应行的各种礼仪活动，也不准皇后到慈宁宫给孝庄请安。
顺治十三年八月，内大臣鄂和之女董鄂氏成为顺治帝的妃子。他对这位年已十八岁的妃子十分满意，称赞她有“母仪之度，性孝敬，知大礼，不以贵自矜”。在顺治帝看来，董鄂氏简直就是绝代佳人，刚入宫顺治帝就封她为贤妃，一个月后董鄂氏又一跃成为皇贵妃，在后宫中地位仅次于皇后。
顺治帝共有见于记载的后妃十八人，能使他为之倾倒的，仅皇贵妃董鄂氏一人。顺治帝几次想废掉第二个皇后立她为为后，但因担心若两度废后，会遭到朝臣更加激烈的反对，所以才没有履行这一手续。
实际上，董鄂氏在宫中无论权力还是待遇，都大大超过皇后。顺治十四年，董鄂氏子生一子，其子仅三月便夭折，顺治帝为安慰董鄂氏，追封这个连名字都没来得及起的孩子为和硕荣亲王。两年后，董鄂氏本人也病逝。钟情的顺治帝为此痛不欲生，亲自为她守灵，又传谕辍朝五天，命亲王以下、四品以上官员和公主、王妃以下命妇，齐集景运门内外为董鄂氏哭灵。
接着，顺治帝追封董鄂氏为“孝献庄和至德宣仁温惠端敬皇后”，并在停灵的承乾宫举行了隆重的追封礼。为了寄托哀思，他命大学士金之俊为董鄂氏作传，又亲自动笔，撰写《孝献皇后行状》。这样，董鄂氏便成了顺治帝的第三位皇后。
第四位皇后是康熙帝的生母佟佳氏，顺治帝在世时是没有名号的庶妃，康熙帝登基后尊为皇太后，康熙二年逝世，年24岁。后累加谥为“孝康慈和庄懿恭惠温穆端靖崇天育圣章皇后”。佟佳氏本是汉军八旗，康熙亲政后，命抬入满洲镶黄旗，后家抬旗之制自此始。
