新疆自古以来就是中国的领土，早在汉朝的时候，汉朝中央政府就在新疆设立了西域都护府，并派官员管理新疆各少数民族事务。此后的历朝历代，也都十分注重对新疆的管辖。晚清时期，沙俄曾入侵新疆伊犁，但是被左宗棠赶走。
民国时期，沙俄以及后来的苏联，还有英国都对新疆虎视眈眈，但是新疆的几任官员都很聪明，牢牢的把新疆控制住，没有把新疆分裂出祖国。解放战争末期，国民党新疆警备区司令员陶峙岳率部和平起义，王震率领一野一兵团立刻进入新疆。
新中国刚建立的时候，中国教育水平落后，缺乏中亚语系的书籍，再加上中苏关系发展很好，所以新疆各少数民族使用的是新疆的书籍，导致一些人的国家认同感降低。1959年后，中苏关系恶化，苏联开始打起了新疆的注意，频繁的派间谍到新疆地区进行分裂活动。
新疆军区副参谋长马尔果夫少将和祖农太也夫少将被苏联情报结构策反，此二人利用自己的职务，频繁的活跃在边境牧场，煽动当地的百姓叛逃苏联，大批边境百姓到苏联领事馆领取了侨民证。1962年4月22日，大批百姓携家带口的涌向霍尔果斯口岸，苏联派了大批国际汽车停在边境线上，这些人乘坐国际汽车前往苏联。
三天的叛逃事件中，先后有六万多人叛逃到苏联。当时各边防站接到的命令是不允许阻拦，新疆军区想要惩罚叛逃的军官，也被拦住了，上级还指示他们为叛逃军官办欢送会。这次叛徒使边境地区的基层政权瓦解，一些县逃的就剩下几百人。1991年苏联解体之后，先后有三万多当年叛逃的百姓因为生活贫困，涌到了霍尔果斯口岸，但是因为失去了中国国籍，被拒之国门之外。
