这个事情与纯惠皇贵妃并无关系，问题主要出在了乾隆第二任皇后辉发那拉氏身上，辉发那拉氏因“擅自断发”而触怒乾隆，最终被不废而废，其去世后虽名义上以皇贵妃礼葬，实际上规格极低，甚至连普通嫔妃都不如，被塞进了纯惠皇贵妃地宫，由此可见乾隆对其恨到了什么地步。
辉发那拉氏与乾隆决裂，乾隆对其恨极
纯惠皇贵妃去世于乾隆二十五年（1760年）四月十九日，于乾隆二十七年（1762年）十一月初二葬入纯惠皇贵妃园寝。而乾隆的第二任皇后辉发那拉氏则去世于乾隆三十一年（1766年）七月十四日，并最终于九月二十八日葬入纯惠皇贵妃的地宫。由此可见，对于纯惠皇贵妃和辉发那拉氏合葬一事，问题主要出在了辉发那拉氏身上。
乾隆三十年（1765年）闰二月十八日，随同乾隆南巡的辉发那拉氏不知因为何事，竟然私自剪断头发，正所谓满人除非国葬不可落发，因而私自断发乃是“国俗所最忌者”。辉发那拉氏因此事而触怒乾隆，最终被率先遣返回京。
南巡结束后，回到京师不久，乾隆便下令收回了辉发那拉氏手中的皇后、皇贵妃、娴贵妃、娴妃四份册宝，又下令裁撤了其手下部分佣人。到七月份时，辉发那拉氏手下只剩两名宫女，按照清宫制度，只有位分最低的答应才会配备两名宫女。而此时，令妃魏佳氏已经被晋封皇贵妃，负责统领后宫。因此，乾隆虽然未曾废除辉发那拉氏的皇后之位，但从待遇等各方面来看，辉发那拉氏已经是不废而废。
乾隆三十一年（1766年）七月十四日，辉发那拉氏薨逝，而当时在木兰狩猎的乾隆帝在得知这一消息后，发了一道上谕，对于辉发那拉氏被废和去世的原因给出了解释，根据《清高宗实录》的记载，乾隆帝对于辉发那拉氏被废的原因解释为“皇后性忽改常，于皇太后前不能恪尽孝道。比至杭州，则举动尤乖正理，迹类疯迷”，而将其死亡的原因归结于“病势日剧，遂尔奄逝。此实皇后福分浅薄，不能仰承圣母慈眷、长受朕恩礼所致”。
从这段记载来看，乾隆显然对辉发那拉氏是恨到了极点，生前将其各种待遇全部降到最低，即使在其去世后，不仅说是她福薄所致，并且也不肯为她举行皇后等级的葬礼。
辉发那拉氏虽然以皇贵妃之礼下葬，但规格甚至不如普通嫔妃
对于辉发那拉氏的葬礼规格，乾隆给出的答案是“所有丧仪，只可照皇贵妃例行，交内务府大臣承办。”然而从实际情况来看，辉发那拉氏的葬礼规格不仅达不到皇贵妃的等级，甚至连普通嫔妃都要不如。
1、丧事简化：按照皇贵妃的丧仪规定，每日应有大臣、公主、命妇齐集举哀、行礼这一项，但辉发那拉氏的丧事当中，这项被取消了。同时，按理皇贵妃的棺木应当用梓木，漆饰35道，抬棺夫96人。但从内务府记载来看，辉发那拉氏所用的乃是杉木，抬棺夫仅有64人，这就是嫔的等级。按照记载，辉发那拉氏整个丧事仅用银200两7钱9分7厘，这还不如一个低级朝廷官员。
2、未单独建陵：按理制，清朝的后妃在去世之后，要么与皇帝合葬，要么葬入妃园寝，而葬入妃园寝的，不论位分多么低，都要单独建陵安葬。然而辉发那拉氏不仅没有附葬裕陵，即使被葬入妃园寝，也没有单独建陵，而是被塞进了纯惠皇贵妃的地宫，位于一侧。
3、祭祀没份：按照清制，凡皇贵妃、贵妃、妃子死后都设神牌，供奉在园寝享殿内，由后人在殿内巨星祭祀；嫔、贵人、常在、答应则不设神牌，祭祀时，只需要将供品桌抬到宝顶前的月台上即可。然而辉发那拉氏既不设神牌，死后也无享祭，入葬以后也只字不提。
根据内务府档案记载，作为一个位号尚存的皇后，死后受此待遇是极为令人侧目的，当时便有名叫李玉鸣的御史因此上书，认为辉发那拉氏的葬礼规格过低，却惹得乾隆恼羞成怒，不仅对其严厉训斥，甚至将其革职锁拏，发往伊犁，并对此通告天下。
种种迹象表明，乾隆对辉发那拉氏的憎恨已经到了无以复加的地步，作为曾经深受宠爱的皇后，为何会与皇帝反目到如此地步，实在令人费解。
