2008年，有关部门的专家们耗时五年时间，通过研究光绪皇帝的头发丝，最终得到了光绪皇帝的死因：死因砒霜中毒。
光绪皇帝死于1908年11月14日，慈禧太后死于1908年11月15日，两人死亡时间相差不到24小时。在人们的心目中，两人死亡时间相隔如此之近，光绪之死是慈禧太后下的毒手。在没有最新证据出现之前，这是目前被大家广为接受的说法。
那么，慈禧太后究竟为何临死前一定要处死光绪，两人究竟有什么不共戴天之仇？慈禧太后和光绪之间的矛盾向来已久，归根到底都是权力之争。慈禧太后要继续“垂帘听政”，最先需要做的事就是牢牢掌控光绪；而希望能有一番作为的光绪要实现亲政，则需要搬掉面前慈禧太后这座大山。
根据大清祖制，皇子在十五岁左右就一定要大婚，大婚后就意味着皇帝要亲政。可慈禧太后一直迟迟不愿给光绪皇帝举办大婚，直到光绪十五年（1889年），光绪19岁时才给他举办大婚。
不仅如此，慈禧太后还一手将侄女安排当了光绪的皇后，让她从中监视光绪。应该说慈禧太后对光绪有养育之恩，同治死后，年仅4岁的光绪进宫，慈禧太后还是尽心尽力的照顾。可在权力面前，亲情却是极其地微不足道。
慈禧太后和光绪两人矛盾的集中爆发，在“戊戌变法”之变后。变法失败后，光绪被囚禁于南海瀛台，彻底成为了傀儡皇帝。很快，慈禧太后以光绪皇帝名义发布谕旨:
“朕躬自四月以来，屡有不适，调治日久，尚无大效。京外如有精通医理之人，即著内外臣工切实保荐候旨，其现在外省者，即日驰送来京，毋稍延迟。”慈禧太后以光绪生病为幌子，准备废黜光绪。
这件事引起了舆论哗然，慈禧希望借助制造光绪病重的假象，让他“彻底消失”。这一切都让光绪对慈禧太后仇视，更过分的是，庚子之变慈禧太后在西逃时，竟然命人将光绪最喜爱的珍妃投井。
一系列重大事件后，光绪恨不得立即诛杀慈禧太后，只恨手中无权。反观慈禧太后，她也深知自己一旦去世，光绪亲自自己必将会死无葬身之地。与其这样，不如先下手为强，正所谓“关怀之殷，情同骨肉；政见之争，有如仇雠。”
参考资料：《清史稿》、《光绪朝东华录》
