清代自建立政权以来，统治者便已经或多或少地认识到了闽台地区海防战略地位的重要性，至嘉庆皇帝时期发展到高潮。
清朝对闽台海防重要性的关注
乾隆元年十一月三十日，台湾御史白起图等奏报：“擒获新港、加志阁二社凶番”，乾隆皇帝回旨：“此等事，从前何以不奏？看来，武弁大有苟且了事之意，甚非慎重海防之道也”。
由此可以初窥乾隆皇帝对闽台区域的重视，并且有了重海防之意。
乾隆二年闰九月十二日，朝廷对于白起图上奏的台湾善后事宜四条加以议论并应奏从之，其中一条就是请求加强对台湾海防的重视。
乾隆十五年，皇帝提出了“国家兵制，水师与陆路并重”，强调要加强水师建设以抵御海盗。
乾隆五十年十月九日，台湾镇总兵柴大纪奏报台湾地区收成雨水情形时，将同一事情分多次上报，乾隆皇帝认为柴大纪此举“如此存心，糊涂取巧，于海疆要任尤非所宜”，因此皇帝叮嘱傅雅德访察，据实奏闻，谕曰：“以重海疆，不可稍存瞻徇”，还提出了“捍御海疆，巡哨洋面”的海防思想。
综上所述，乾隆年间，皇帝及政府官员对于福建台湾两地的战略重要性认识是相当充分的，并且多数都已经体现出了通过建设海防而达到“靖海疆、安良善”的效果。
嘉庆年间，闽、台遭到海盗侵袭较为严重，统治者对两地战略地位重要性的认识更加充分，主要表现为统治者对海洋防御力量建设力度的增大。
嘉庆元年正月闽浙总督魁伦上奏，请求台湾海域沿岸各水师加强巡防，以辑盗匪。二月皇帝谕军机大臣：“台湾远隔重洋，民俗习悍”，要求驻地水师严厉审查“纠人谋逆之犯”，以“昭法纪而肃海疆”。
嘉庆四年（1799 年），皇帝谕内阁：“漳州滨海重地，必得实授之员，方足以整饬”。
嘉庆十七年（1812年）二月二十七日，皇帝谕军机大臣等：“闽省洋面仍劫掠频闻，是闽省水师缉捕松弛……不可不速加整饬”。
传谕给汪志伊：“严饬水师各将弁，分探盗踪，认真搜缉，悉数殄除，务令海氛永靖”。
要求闽省水师官员一定要注意加强区域水师建设，提高剿匪能力。嘉庆二十五年谕军机大臣等：“澎湖孤悬海外，地方险要，副将统辖舟师，责任綦重”。
充分意识到加强闽台海域军事力量的必要性，同时还认识到发展台湾经济的重要性，“谕民广为播种，不可稍有怠惰”，以台米接济福、兴、漳、泉四府。
著名学者对闽台海防战略地位的认识
清代许多有识之士认识到海防建设的重要性，他们总结了明代海防建设的内容、选择性地继承了其经验教训。从海洋地理环境着手，认真分析了闽、台等地的海域地理形势、地理特点、岛屿战略地位，探究其军事价值，为乾嘉时期闽台海防建设部署、海防力量训练、和海洋作战提供了重要的理论依据。
汪志伊，安徽桐城人，清代文学家，嘉庆二年任职福建布政史，后升职为福建巡抚。
嘉庆四年，奉上谕复奏《地方海口情形折》，对福建省的山川地理、海疆形势进行了详细分析：“闽洋北接浙江、南连粤省，延袤二千余里岛屿，周回口岸丛错”，“设立水师三十一营，兵二万七千七百三十名，大小战船二百六十六只，分列南北为犄角之势，中以泉州之崇武为界”。
也陈述了沿海洋盗危害严重的情形：“自洋盗滋扰，商累而民亦累，诚如圣谕必须洋面肃清，而商民仍无妨碍，方为尽善”。
他认为早日剿灭海盗，才能够保障商人和民众的正常交往与生活。汪志伊针对水师建设问题也提出了自己的看法，一是关于建设炮台的重要性：“一炮可当千军之用，此洋盗所由不敢近岸，而各口岸亦无庸添设重兵也”。
二是建议要加强水师训练：“兵丁可百年不用，不可一日不操……惟有随时训练，以归实际”。
由此语可以看出汪志伊对福建水师的建设和训练极为重视。
严如熤，湖南溆浦人，是清中期著名的舆地学家，嘉庆十年，作者协助两广总督筹划海防、镇压海盗，在此过程中有所感悟，写下《洋防辑要》一书。
嘉庆年间，广东一带海盗活动频发，严如熤深刻认识到海防建设的重要性，将自己的考察分析著书立论，希望后人能够从中得到认识与借鉴。
《洋防辑要》收录了大量沿海地形图，不仅有中国福建、浙江、广东等沿海省份，还包括高丽、安南、东南洋、西南洋等地的外夷国家，在解决海防问题时查阅，能够获取相关理论指导。
作者在书籍开篇中就介绍了著书目的、内容和对前人著作的借鉴，主要是对顾祖禹和顾炎武两人地理著作的借鉴，“少事乃取景范读史舆地纪要”、“取宁人郡国利病书”。
其目的是为了便于后人查阅与海防相关联的理论知识。内容主要包括福建、浙江、广东的海疆地理和兵防兵事。书中记载福建省是清代的海防前线，还记载道：“（福宁县）当东南西三面之冲，岛夷有事，必先犯此，最为要地 ”。
严如熤也将关于海上交通路线描绘的内容辑入《洋防辑要》中，清王朝时期我国沿海航船路线主要有四条：
一是从福建省厦门岛出发，向东航行，可以到达澎湖、台湾地区，还可以由此地转往吕宋、琉球等地；
二是沿海从福建西南出发，经过南澳岛，到达广东沿海区域，再从此地向南洋各国航行；
三是从福建海域出发，沿海一直向北部航行，能抵达江浙地区；
四是由江浙沿海出发，向东航行，最后到达琉球、日本等国。
由此充分认识到福建海域的交通枢纽地位，这些行船航线在军事物资运输上有重要作用。乾嘉时期的学者大都认识到了闽、台沿海地区对于祖国大陆所起的保护作用，且强调了闽、台在国际海上交通线的枢纽地位，呼吁加强海防建设。
这些先进认识为清代中期海防建设的兵力部署及调整和海防斗争提供了宝贵的理论依据。
